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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002387`

染色体: Chr02 坐标: 41811740-41812150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002387`
名称	SmilChr02G002387
描述	uncharacterized SmilChr02G002387
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41811740 - 41812150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008480`
GeneID	`131008480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008480`
原始查询	`LOC131008480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0652700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0652700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G24130` (AT4G24130) DUF538 family protein (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828513] identity=43.5; qcov=0.963; evalue=5.81e-36; confidence=medium
Rice	`Os01g0652700` - identity=77.9; qcov=1; evalue=4.77e-69; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791337.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791337.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791337.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791337.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791337.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41811866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B125,B76,C46
`Chr2:41811883`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B83
`Chr2:41811883`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B83
`Chr2:41812072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:41812087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr2:41812102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791337.1

136 aa

136

DUF538

PF04398 DUF538 22-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791337.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	22	133	1.8e-33	116.0	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935354.1
ATGGCGGAAAGGGAAGGAGCAGTCGTAAAGCAAGGCCATGAAGAAGGGCTGAAGATGGCCGTAGCCCTCCTCGAAGAGTTCGAGCTTCCAAGTGGGCTCCTCCCATTGGCTGATGTGGTCGAGGTCGGCTTCGTGAGGAGCACCGGATACATGTGGATTCAGCAGAAGAAGAAGATCGAGCACAACTTCAAGGTCATCAGCAAGCTCGTCAGCTACGACACCAATATAACTGGTTATATGGAGAAGAAGAGGATCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008480
ATGGCGGAAAGGGAAGGAGCAGTCGTAAAGCAAGGCCATGAAGAAGGGCTGAAGATGGCCGTAGCCCTCCTCGAAGAGTTCGAGCTTCCAAGTGGGCTCCTCCCATTGGCTGATGTGGTCGAGGTCGGCTTCGTGAGGAGCACCGGATACATGTGGATTCAGCAGAAGAAGAAGATCGAGCACAACTTCAAGGTCATCAGCAAGCTCGTCAGCTACGACACCAATATAACTGGTTATATGGAGAAGAAGAGGATCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791337.1
MAEREGAVVKQGHEEGLKMAVALLEEFELPSGLLPLADVVEVGFVRSTGYMWIQQKKKIEHNFKVISKLVSYDTNITGYMEKKRIKKLKGVKAKELMLWPPVSEIILVDPPTGKINFKSLAGITKTFPVEAFAAGQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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