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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002409`

染色体: Chr02 坐标: 42044580-42045591 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002409`
名称	SmilChr02G002409
描述	uncharacterized SmilChr02G002409
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42044580 - 42045591 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008487`
GeneID	`131008487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008487`
原始查询	`LOC131008487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G04420` (AT2G04420) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814982] identity=26.8; qcov=0.602; evalue=1e-08; confidence=low
Rice	`Os06g0683500` - identity=30.7; qcov=0.487; evalue=3.36e-13; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791344.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791344.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791344.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791344.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791344.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42044826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B44,B71,B82,D5
`Chr2:42044827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B44,B71,B82,D5
`Chr2:42044848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B20
`Chr2:42044848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:42044850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A16,B100,B37,B68,B78,C30,C44,C47,C70,C8
`Chr2:42045041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,C84,D11
`Chr2:42045089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,C84,D11
`Chr2:42045113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,C84,D11
`Chr2:42045141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	112	A14,A18,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A6,A7,A8,A9,B10,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B11,B110,B113,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B131,B133,B134,B135,B14,B140,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B34,B36,B4,B41,B42,B43,B48,B50,B52,B57,B59,B60,B63,B67,B70,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B84,B86,B88,B89,B9,B99,C1,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C24,C26,C28,C3,C30,C35,C37,C38,C39,C41,C46,C47,C48,C51,C55,C57,C58,C63,C64,C66,C70,C75,C77,C80,C9,D1,D10,D2,D7
`Chr2:42045178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C34,C50,C76,C82
`Chr2:42045185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C84
`Chr2:42045196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791344.1

261 aa

130

261

RVT_3

PF13456 RVT_3 122-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791344.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	122	241	1e-16	61.7	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935361.1
ATGGGGAGTGTGGATTTGGGAATGGCATATTCCCGTTCGGAGATCTCTGGTTTGTTGGCGGATTCTTCATGGGAAAATGCCAACGGAGCATTTTGGATGTCCAGGATGTTCACAGCCTTTTGGTGGCTGCATGGAATAGAGAGCTTAGTCCTCAAGTGGCTTGCTTCTGGAAAGCTGGTTATTCAGTTCATTAAAGTGGCGTTCCTTGATATTGAGCAAAACTTTAAGAAGATTGGTCGCATGGCTAATTCTTGTCAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008487
ATGGGGAGTGTGGATTTGGGAATGGCATATTCCCGTTCGGAGATCTCTGGTTTGTTGGCGGATTCTTCATGGGAAAATGCCAACGGAGCATTTTGGATGTCCAGGATGTTCACAGCCTTTTGGTGGCTGCATGGAATAGAGAGCTTAGTCCTCAAGTGGCTTGCTTCTGGAAAGCTGGTTATTCAGTTCATTAAAGTGGCGTTCCTTGATATTGAGCAAAACTTTAAGAAGATTGGTCGCATGGCTAATTCTTGTCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791344.1
MGSVDLGMAYSRSEISGLLADSSWENANGAFWMSRMFTAFWWLHGIESLVLKWLASGKLVIQFIKVAFLDIEQNFKKIGRMANSCQDLMVLRKLGVKPRAAPPPTFINVYWWPPPNQWIKVNTDGSALGAPGKIAAGGVFRDKFSWVRGCFHIKGGIGFAFEAELLAVISAIQIAFYKNWRYLWIESDSTYIVNLLHSRSLNVPWRFAARWREVLVLLSEFNLHITHIFREGNKVADILAADNVQEGWWPMEIDAIYQES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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