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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002418`

染色体: Chr02 坐标: 42172958-42173848 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002418`
名称	SmilChr02G002418
描述	uncharacterized SmilChr02G002418
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42172958 - 42173848 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008491`
GeneID	`131008491`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008491`
原始查询	`LOC131008491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=24.7; qcov=0.943; evalue=9.62e-13; confidence=weak
Rice	`Os03g0643433` - identity=29.2; qcov=0.659; evalue=1.31e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008491

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791348.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791348.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791348.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791348.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42172995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:42173005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C55
`Chr2:42173007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B124
`Chr2:42173079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:42173142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr2:42173158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B5
`Chr2:42173162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:42173167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:42173306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B134,B42,B45,C32
`Chr2:42173325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B9,C38,D5
`Chr2:42173331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B125,B79,C34
`Chr2:42173351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C52,C85,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791348.1

296 aa

148

296

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 101-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791348.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	101	194	6.7e-18	65.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935365.1
ATGGAAATTCAAGTTGGAGACGGGGCAGGCTTTATCTTTTGGAACCACCTGTGGATTGGAGAAAGTAGACTCTCCGATCAATTCCCAAGACTCTATCGTCTTAGCAGCAACCAGAATGGATCAATCTCGAGCATGGGGGAGTGGAAGGAGGGAGAGTGGGTGTGGAGTTTCAGTTGGAACCGGGAGCTTTTAGAAAGAGAGAAGGAGCAGGTGCAGCGTCTAGTCAATATTATCAAACACGTCCGAATTTGTGAGGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008491
ATGGAAATTCAAGTTGGAGACGGGGCAGGCTTTATCTTTTGGAACCACCTGTGGATTGGAGAAAGTAGACTCTCCGATCAATTCCCAAGACTCTATCGTCTTAGCAGCAACCAGAATGGATCAATCTCGAGCATGGGGGAGTGGAAGGAGGGAGAGTGGGTGTGGAGTTTCAGTTGGAACCGGGAGCTTTTAGAAAGAGAGAAGGAGCAGGTGCAGCGTCTAGTCAATATTATCAAACACGTCCGAATTTGTGAGGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791348.1
MEIQVGDGAGFIFWNHLWIGESRLSDQFPRLYRLSSNQNGSISSMGEWKEGEWVWSFSWNRELLEREKEQVQRLVNIIKHVRICEGKADKWRWKASKDDSFTVKSAYKTISAADGRNSIRGSDLELAIIWKAPAPPKVITTAWKALRGRMATCENLLKRKVNIQHQEALCVFCKATIETADHLFLSCDKVYQLWSEVVAWLGKQTVLPCKVKNHFNAFINLGCKKEKRFLLSVWSGVIWSIWKVRNECKFQLGEWNSYKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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