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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002576`

染色体: Chr01 坐标: 43910614-43915558 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002576`
名称	SmilChr01G002576
描述	two-component response regulator ORR26-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43910614 - 43915558 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008496`
GeneID	`131008496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008496`
原始查询	`LOC131008496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ORR26-like
产物	two-component response regulator ORR26-like
Arabidopsis	`AT3G16857` (RR1) response regulator 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820940] identity=35; qcov=0.871; evalue=3.58e-43; confidence=medium
Rice	`Os01g0904700` (RR26) - identity=37.5; qcov=0.858; evalue=2.5e-44; confidence=medium
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0003677 (DNA binding); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791353.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791353.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791353.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791353.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791353.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43910714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:43911867`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,B99
`Chr1:43911867`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B55,B99
`Chr1:43911874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:43911937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:43912988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C18
`Chr1:43913098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:43913309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:43913367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B130
`Chr1:43914054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791353.1

295 aa

148

295

Response_reg

Myb_DNA-binding

PF00072 Response_reg 21-126 aa PF00249 Myb_DNA-binding 218-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791353.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	21	126	7.9e-13	49.3	Response regulator receiver domain
`XP_057791353.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	218	264	7.4e-08	33.1	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935370.1
ATGTGGGAAGCTGGTAGAAACAATTCGCCATTGGCTCATGCTATGATGCATGGAATTCATGTTTTATTAGTGGATCATGATGCAGAAGCTTTAATCAATACAGCAAAGCAACTCGAAATGTGCCAGTACAAAGTTACATTTGTTGAGCATGCATCTGCTGCAATATCGATGCTCCCTAGTGGAAAGGCTAAATTTGATGCTGTGATAGCAAACATCAACTCTCCTGATCTCCATGGATTCAAACTTCTCCAACATGCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008496
ATGTGGGAAGCTGGTAGAAACAATTCGCCATTGGCTCATGCTATGATGCATGGAATTCATGTTTTATTAGTGGATCATGATGCAGAAGCTTTAATCAATACAGCAAAGCAACTCGAAATGTGCCAGTACAAAGTTACATTTGTTGAGCATGCATCTGCTGCAATATCGATGCTCCCTAGTGGAAAGGCTAAATTTGATGCTGTGATAGCAAACATCAACTCTCCTGATCTCCATGGATTCAAACTTCTCCAACATGCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791353.1
MWEAGRNNSPLAHAMMHGIHVLLVDHDAEALINTAKQLEMCQYKVTFVEHASAAISMLPSGKAKFDAVIANINSPDLHGFKLLQHAVYMCIPVVLMSDDDDAFIAMRALEHGAFLYIKKPISMEFLRCLWQHVVREKTRMVRERDMFIASNNLASVRSVQFREVTHPRDENPNPNHNMAMKNKGKCKSKGRCRYDDYSEEYDSESHVKGNVRRKICTEWTQELHTKFMNAIEQLGEGRCFPKEILEMMNEPGLTRMQVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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