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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002454`

染色体: Chr02 坐标: 42822270-42822856 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002454`
名称	SmilChr02G002454
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42822270 - 42822856 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008498`
GeneID	`131008498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008498`
原始查询	`LOC131008498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=36.1; qcov=1.05; evalue=6.15e-39; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=44.2; qcov=1.05; evalue=1.09e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791354.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791354.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791354.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791354.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42822320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:42822348`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B136,B29,B58,C33,C65
`Chr2:42822348`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B136,B29,B58,C33,C65
`Chr2:42822358`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr2:42822358`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr2:42822363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B136,B29,B58,C33,C65
`Chr2:42822363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B29,B58,C33,C65
`Chr2:42822377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B87
`Chr2:42822427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:42822430`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B132,B16,B17,B34,B90,B92,C12,C32,C56,C68,C81,D6
`Chr2:42822432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C53
`Chr2:42822466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791354.1

181 aa

181

RVT_2

PF07727 RVT_2 1-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791354.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	1	56	9.9e-09	35.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935371.1
ATGTCAAAGGAGTTTGAGATGACCAACATTGGGCTGATGGCGTACTATCTCGGTGTGGAAGTCAAGCAACTCGAAGATGAGATCTTCATCACACAAGAAGGTTACGCCAAGGAAATTCTCAAGAAGTTCAAGATGGAGGACTGCAAGGCAATCAACACACCAGTGGAGTGTGGGATCAAATTATCCAAGAACGACGGAGGAGAAAAAGTAGATCCGACATTATTCAAGAGCTTGGTTGGAAGCCTACGATACTTAACTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008498
ATGTCAAAGGAGTTTGAGATGACCAACATTGGGCTGATGGCGTACTATCTCGGTGTGGAAGTCAAGCAACTCGAAGATGAGATCTTCATCACACAAGAAGGTTACGCCAAGGAAATTCTCAAGAAGTTCAAGATGGAGGACTGCAAGGCAATCAACACACCAGTGGAGTGTGGGATCAAATTATCCAAGAACGACGGAGGAGAAAAAGTAGATCCGACATTATTCAAGAGCTTGGTTGGAAGCCTACGATACTTAACTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791354.1
MSKEFEMTNIGLMAYYLGVEVKQLEDEIFITQEGYAKEILKKFKMEDCKAINTPVECGIKLSKNDGGEKVDPTLFKSLVGSLRYLTCTRPNILYATGLAAKRILRYLKGTLDYGLFYSNTDDYKLVGHSDSDWAGDNDDQKSTSGFVFFMRDTVFTWMSKKQSIVMLSTCEAEYVAATFSV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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