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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002495`

染色体: Chr02 坐标: 43390317-43391754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002495`
名称	SmilChr02G002495
描述	uncharacterized SmilChr02G002495
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43390317 - 43391754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008504`
GeneID	`131008504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008504`
原始查询	`LOC131008504`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=53.6; qcov=0.467; evalue=1.26e-56; confidence=medium
Rice	`Os09g0290900` - identity=71.8; qcov=0.287; evalue=5.89e-52; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791358.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791358.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791358.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791358.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43390354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:43390368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,A5,B60
`Chr2:43390380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A10,A22,A3,B107,B11,B118,B122,B129,B135,B140,B16,B17,B22,B23,B30,B34,B36,B45,B47,B50,B51,B53,B58,B60,B63,B65,B67,B69,B81,B84,B91,C1,C10,C13,C18,C19,C2,C22,C23,C26,C32,C36,C37,C38,C39,C40,C52,C55,C58,C6,C63,C68,C76,C81,C82,C84,C87,D2,D4
`Chr2:43390542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr2:43390547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:43390548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:43390619`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A22
`Chr2:43390619`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A22
`Chr2:43390656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B22,B28,C58
`Chr2:43390666`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B22
`Chr2:43390666`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B22
`Chr2:43390668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791358.1

383 aa

192

383

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 128-199 aa PF14291 DUF4371 199-303 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 218-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791358.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	128	199	3.6e-57	194.4	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057791358.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	199	303	3.6e-57	194.4	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057791358.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	218	309	2.3e-06	28.1	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935375.1
ATGGCAAGTGAAACTCCTAAATCAAAAAAATCAAAAGGAATGACAAAACAACCCGATCTTCGGCAATTTATGTTCAAGAAAATGAAATCTCAAGAGAGTGAGTCTTCTTCTCCAACAGATAAGTTACCTCAAGCTCAAGAAAATGTTATAAATTTGGGTGGTTCAAGTAGTACTTGTTTGCCATTAGAGGATAAAGAATTGATTTATGATGTTGAGCTTCTTCCTCATGACCCGGGAAAAAGAATTAGTATAATGGATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008504
ATGGCAAGTGAAACTCCTAAATCAAAAAAATCAAAAGGAATGACAAAACAACCCGATCTTCGGCAATTTATGTTCAAGAAAATGAAATCTCAAGAGAGTGAGTCTTCTTCTCCAACAGATAAGTTACCTCAAGCTCAAGAAAATGTTATAAATTTGGGTGGTTCAAGTAGTACTTGTTTGCCATTAGAGGATAAAGAATTGATTTATGATGTTGAGCTTCTTCCTCATGACCCGGGAAAAAGAATTAGTATAATGGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791358.1
MASETPKSKKSKGMTKQPDLRQFMFKKMKSQESESSSPTDKLPQAQENVINLGGSSSTCLPLEDKELIYDVELLPHDPGKRISIMDYPPNERDVVRRAYILKNLVNQKLMIFLAKTLENEVGLNAGGDAFVNRGFKSWNKPERFLKHVGVVKSAHNLAYEKYANLRDGKKKSILISFENDTDVIQREYEIRLKASISYIINCCAKETTKRIVEELGDGYFAILAYESSDVSQKEQLALCLFYVEGKMGKVVERFLGLVHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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