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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004517`

染色体: Chr02 坐标: 67696479-67700983 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004517`
名称	SmilChr02G004517
描述	factor of DNA methylation 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67696479 - 67700983 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008508`
GeneID	`131008508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008508`
原始查询	`LOC131008508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	factor of DNA methylation 1-like
产物	factor of DNA methylation 1-like
Arabidopsis	`AT1G15910` (FDM1) XH/XS domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838161] identity=53.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0633200` (X1) - identity=47.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0080188 (gene silencing by siRNA-directed DNA methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03468 (XS); PF03469 (XH); PF03470 (zf-XS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791361.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791361.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791361.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791361.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67697762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C16,C21
`Chr2:67698057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:67698585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:67700431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C18,C49
`Chr2:67700471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:67700532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791361.1

636 aa

318

636

zf-XS

PF03470 zf-XS 44-86 aa PF03468 XS 116-224 aa PF03469 XH 503-634 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791361.1`	Pfam	`PF03470`	zf-XS	Domain	44	86	1.4e-19	70.8	XS zinc finger domain
`XP_057791361.1`	Pfam	`PF03468`	XS	Domain	116	224	1e-32	113.5	XS domain
`XP_057791361.1`	Pfam	`PF03469`	XH	Domain	503	634	3.1e-56	189.6	XH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935378.1
GCCTAATAGGCTAAAGCTGGCACTCATAATTTCCCACTTATTTCCTCCCAATTCCATTCCTGCCCCTTTTTTCTTACTTCTAGCTCTAGGGTGGATTTCCGGCCGAATTCTCCACCACAGGCGTCACCCCACCCCACCCGACCACCTCCACCACTCCCAAGATGGGAAGCAGCAGCTCGGACGAAGAGTCAGATTTCAGTGACTCAGAAATAAATGAATATAAAGTGAAACCTTACGAGTTACTTAAGGCGGGTACTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008508
ATGGGAAGCAGCAGCTCGGACGAAGAGTCAGATTTCAGTGACTCAGAAATAAATGAATATAAAGTGAAACCTTACGAGTTACTTAAGGCGGGTACTTACAAAGTAAAGGGCCCCAAAGGTTCTCTTAGGTGTCCTTTCTGTGCTGGTAAGAAGAAACAAGATTATCAGTATAACCATCTTCTTCAGCATGCCATTGGAGTAGCTAAGGGTGCTGCCAGCCGAAGTGCAAAACAGAAAGCTAACCATCTAGCGCTAGCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791361.1
MGSSSSDEESDFSDSEINEYKVKPYELLKAGTYKVKGPKGSLRCPFCAGKKKQDYQYNHLLQHAIGVAKGAASRSAKQKANHLALATFLEKDMASEAEPMPQPSISIPDPKPEKSELYCWPWVGIVANIQDEPKSSGSADRDAYWLKKFSRYKPIKIEMFWDDQQPNAQAVLRFDHDWFGFKNAMEFEKSFEADGQSKKGWDERRTSPGPNLYGWFAREDDYNSGGPVGNYLRRKGELKTIADLVQEATQDRDTIVGNLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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