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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004523`

染色体: Chr02 坐标: 67804210-67806400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004523`
名称	SmilChr02G004523
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67804210 - 67806400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008514`
GeneID	`131008514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008514`
原始查询	`LOC131008514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
产物	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
Arabidopsis	`AT5G47690` (AT5G47690) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834820] identity=52.6; qcov=0.22; evalue=1.58e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0612800` (BIP135) - identity=45.1; qcov=0.295; evalue=2.65e-09; confidence=weak
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791369.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791369.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791369.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791369.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791369.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67804675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B28,B80
`Chr2:67804681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B90
`Chr2:67804721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,B98
`Chr2:67804765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B52,B80,B99,C34
`Chr2:67804778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B28,B52,B80,C34
`Chr2:67805325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B48,B89,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935386.1
GAAGAACTTTGCTTCGATATAGAAGTTGGTTGATCTGTCGGTATCATAGATGATAGTATTTTCCTTTTCTTTTTTCTGGTTGTTACCACTTATCATGATGAGATCCTCAGTGTAAAAAACCGGGTATTGTGCATCATCCTTGTGGTGCTCTTGCAGTCCTAGGGGCAAGTTAGTTATAGTTCACACGGCCAACTTATTCAATGTCTTGATAGTTTTGGATTTTACACATGCTTTGTCTAAAAAATAGCAAGATTTTCTCA...

XM_057935387.1
AACTTTGCTTCGATATAGAAGTTGGTTGATCTGTCGGTATCATAGATGATAGTATTTTCCTTTTCTTTTTTCTGGTTGTTACCACTTATCATGATGAGATCCTCAGTGTAAAAAACCGGGTATTGTGCATCATCCTTGTGGTGCTCTTGCAGTCCTAGGGGCAAGTTAGTTATAGTTCACACGGCCAACTTATTCAATGTCTTGATAGTTTTGGATTTTACACATGCTTTGTCTAAAAAATAGCAAGATTTTCTCACATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008514
ATGCTTTGTCTAAAAAATAGCAAGATTTTCTCACATGTAACGTTCATCACACACAGGTTTTATGCAGGCACTGTTAAAGCTTTTGATCCTGAAACAAAGAAACATGAGGTTTTGTATGACGATGATGAAATAGAGTTCTTGAATCTGAGAAAAGAAAAATGGAAACTGTATGGTGATGAGCAGTCTCTACAAAAACAAGTAGCTTCATCTCCTTCCAGAGAACTTATCAAGACTAAAGAAAACACAAAAAGAAAAGTAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791369.1
MLCLKNSKIFSHVTFITHRFYAGTVKAFDPETKKHEVLYDDDEIEFLNLRKEKWKLYGDEQSLQKQVASSPSRELIKTKENTKRKVGTLKKQQQHPASSSKRSKGESHALSKSEDTSSPGFHQVATELGEETCEPNASAKDGGRNRVGKEESEILIKKMQGDHIQEDEKNDSMARTNH

XP_057791370.1
MLCLKNSKIFSHVTFITHRFYAGTVKAFDPETKKHEVLYDDDEIEFLNLRKEKWKLYGDEQSLQKQVASSPSRELIKTKENTKRKVGTLKKQQQHPASSSKRSKGESHALSKSEDTSSPGFHQVATELGEETCEPNASAKDGGRNRVGKEESEILIKKMQGDHIQEDEKNAFP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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