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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004525`

染色体: Chr02 坐标: 67838849-67840925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004525`
名称	SmilChr02G004525
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67838849 - 67840925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008517`
GeneID	`131008517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008517`
原始查询	`LOC131008517`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic
产物	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G15980` (PnsB1) NDH-dependent cyclic electron flow 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838168] identity=73; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0276100` - identity=62.8; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0010598 (NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone))
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791372.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057791372.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057791373.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057791372.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057791373.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67838938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:67839536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:67839650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,C86
`Chr2:67839703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:67839773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B33,C85
`Chr2:67840007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:67840044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B34
`Chr2:67840127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B68,B69,C30,C40
`Chr2:67840245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr2:67840274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B47,D10
`Chr2:67840275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr2:67840286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935389.1
TGGCGGGGAGGTAAGGGGACCATCCTCTTATCCCAACTATCTTCACACATTCAAATCCAACGTTAACGAAAACCCGACACTCAATGAAGCTTATCTACTCCTTACCAATTCTCCTTTCACCACACCAAAAAAATAAAAATGGGTGTCCTTGCTCCAAAACCAATCCCACCATGCCTCACAATCCCTCCCTCAATCCCACTCTTCCACTCCACCAATCTATCCTTGTTGGATCAACCCTTTCCCACCCGTAAAACGGCCTC...

XM_057935390.1
GGGGAGGTAAGGGGACCATCCTCTTATCCCAACTATCTTCACACATTCAAATCCAACGTTAACGAAAACCCGACACTCAATGAAGCTTATCTACTCCTTACCAATTCTCCTTTCACCACACCAAAAAAATAAAAATGGGTGTCCTTGCTCCAAAACCAATCCCACCATGCCTCACAATCCCTCCCTCAATCCCACTCTTCCACTCCACCAATCTATCCTTGTTGGATCAACCCTTTCCCACCCGTAAAACGGCCTCCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008517
ATGGGTGTCCTTGCTCCAAAACCAATCCCACCATGCCTCACAATCCCTCCCTCAATCCCACTCTTCCACTCCACCAATCTATCCTTGTTGGATCAACCCTTTCCCACCCGTAAAACGGCCTCCCAATTCCGCCCCAATGCCAAGAAGAAGAACCCATGGCTCGACCCTTTCGATCAGGGCGACGACCCGGAGATGGAGTACGGCCAGCTCTTCTCCGACGGGAAGCAGGAGGAGGATCCCAGGCCGCCCGACAACCCGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791372.1
MGVLAPKPIPPCLTIPPSIPLFHSTNLSLLDQPFPTRKTASQFRPNAKKKNPWLDPFDQGDDPEMEYGQLFSDGKQEEDPRPPDNPGNPYGFLKFPPGYAVEIASLGLKIRGDVRRCCCVVSGGVYENLLFFPAIQMIKDRYPGVQVDVVTTARGKQTYEINKNVRFVDVYDVDDPFPEPADYTDMIGQLKNRYYDMILSTKLAGIGHGAFLFMSSARDVVSYVYPNVNAAGAGLFLSETFTPATDNLSDGGYHMYREMI...

XP_057791373.1
MGVLAPKPIPPCLTIPPSIPLFHSTNLSLLDQPFPTRKTASQFRPNAKKKNPWLDPFDQGDDPEMEYGQLFSDGKQEEDPRPPDNPGNPYGFLKFPPGYAVEIASLGLKIRGDVRRCCCVVSGGVYENLLFFPAIQMIKDRYPGVQVDVVTTARGKQTYEINKNVRFVDVYDVDDPFPEPADYTDMIGQLKNRYYDMILSTKLAGIGHGAFLFMSSARDVVSYVYPNVNAAGAGLFLSETFTPATDNLSDGGYHMYREMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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