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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004535`

染色体: Chr02 坐标: 67909619-67911240 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004535`
名称	SmilChr02G004535
描述	uncharacterized SmilChr02G004535
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67909619 - 67911240 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008529`
GeneID	`131008529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008529`
原始查询	`LOC131008529`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.7; qcov=1.01; evalue=9.83e-53; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.2; qcov=1.02; evalue=1.08e-58; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791414.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791414.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791414.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791414.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67910304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:67910305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C36
`Chr2:67910318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B37,B56,B8
`Chr2:67910339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B13,B53,C73
`Chr2:67910402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B43,B69
`Chr2:67910414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B79,B9,C39
`Chr2:67910440`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B64
`Chr2:67910440`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B64
`Chr2:67910453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C35
`Chr2:67910453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr2:67910467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B118,B57,C69
`Chr2:67910475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C45,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791414.1

470 aa

235

470

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 86-179 aa PF00872 Transposase_mut 102-226 aa PF04434 SWIM 331-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791414.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	86	179	5.6e-19	69.0	MULE transposase domain
`XP_057791414.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	102	226	1.7e-10	41.0	Transposase, Mutator family
`XP_057791414.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	331	360	0.00011	22.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935431.1
CCATCATGGCTGAGTTAGTACGCGATTTCGGCATCAAAATCAAATATGATGTCGCGCTGCGTGCAAGAAATCTCGGGATGGATATGATATACGGTCGAGTTGATGATTCGTTCCTCCTGCTCCCAAGATATCTGTATGCCCTGAAGGAAGCGAATCCTGGCACCTTATATGATTTGGAAGCAGATATAGACTGCCGGTTCAAACATTTGTTTGTTGCTCTGGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTACTTTCACCTTCGACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008529
ATGGCTGAGTTAGTACGCGATTTCGGCATCAAAATCAAATATGATGTCGCGCTGCGTGCAAGAAATCTCGGGATGGATATGATATACGGTCGAGTTGATGATTCGTTCCTCCTGCTCCCAAGATATCTGTATGCCCTGAAGGAAGCGAATCCTGGCACCTTATATGATTTGGAAGCAGATATAGACTGCCGGTTCAAACATTTGTTTGTTGCTCTGGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTACTTTCACCTTCGACCAGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791414.1
MAELVRDFGIKIKYDVALRARNLGMDMIYGRVDDSFLLLPRYLYALKEANPGTLYDLEADIDCRFKHLFVALAASISPFYFHLRPVIVVDGTHLKGKNSGILFVAVTKDGNEAVFPLAIGVGPIENDESWKWFMSHLRGACGEPDNLLIVSDAHVSIANAVKSEFPNATHGICYYHLLNKMKGYGPGVAELFRQAAYAYEQSDYTRAMSAMAALKPKAYEKLLRVGPEKWARSQCPVSRYSFLTSNAAESFNARLLWARR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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