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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004555`

染色体: Chr02 坐标: 68078785-68081932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004555`
名称	SmilChr02G004555
描述	uncharacterized SmilChr02G004555
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68078785 - 68081932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008549`
GeneID	`131008549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008549`
原始查询	`LOC131008549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0307900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0307900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0307900` - identity=30.8; qcov=0.118; evalue=2.84e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04195 (Transposase_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791444.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791444.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791444.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791444.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791444.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68078903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr2:68078914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C81,C82,C84
`Chr2:68078925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C32
`Chr2:68078943`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A7,B69,B93,C3
`Chr2:68078943`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A7,B69,B93,C3
`Chr2:68078946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr2:68078954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C50,D4,D9
`Chr2:68078981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:68078986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C34
`Chr2:68078992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:68078993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B13,C49,C55
`Chr2:68079004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791444.1

910 aa

455

910

Transposase_28

PF04195 Transposase_28 113-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791444.1`	Pfam	`PF04195`	Transposase_28	Family	113	175	1.2e-07	32.6	Putative gypsy type transposon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935461.1
AGTCAATCTTTATTTGACCTAGGTAATTCGCGTACCTTCCTCTCCTAATTTTTGTGATTAGTTGTAGTGTAATGGTATAATTATTGGTGCTCTGATTGAGCGTGCTAGAAACCCTAGGATTGACATTTCCGACCATGGCCTCCACTTCCGCTCCTCAGTTCTCGCATTCGCCTTCCCCTTCCCCTCAAGCTTCTTCATCTTCCTCCCCCCAACTCCAGGATCTCGAGAGCCTCCCTTCCCCCTCTGCCTCTTATGATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008549
ATGGCCTCCACTTCCGCTCCTCAGTTCTCGCATTCGCCTTCCCCTTCCCCTCAAGCTTCTTCATCTTCCTCCCCCCAACTCCAGGATCTCGAGAGCCTCCCTTCCCCCTCTGCCTCTTATGATTCTCCAATTATTCCCAGTTCTTCTCCGCCTAAAAGAAGGGGTAAGAAGACACCCCAACCCCCCAAGTGTATTCCTGAATCCCGCCTCAGTGTCGCGGAGATGGACAAAATGCGACGCAAGTGTTGCTGCCCCCTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791444.1
MASTSAPQFSHSPSPSPQASSSSSPQLQDLESLPSPSASYDSPIIPSSSPPKRRGKKTPQPPKCIPESRLSVAEMDKMRRKCCCPLGLQFIAFSKDSTPPEKLYDHKTVAIWKAQIDAGLRLPPPPFLAEVCNYYRIPFYQLTPSAIRRLYAFHILCRFHGVGDTAQLFFQTQSLRMQNSPLYSFASLKKYPTTFLSSLNSHDKNFLFQYCYVRTLSGSWREYFVSELQWHNPRTTYKPASPDAPSTFDLGVIAHLNAMN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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