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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002612`

染色体: Chr01 坐标: 44375107-44380066 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002612`
名称	SmilChr01G002612
描述	probable transcriptional regulator SLK2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44375107 - 44380066 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008562`
GeneID	`131008562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008562`
原始查询	`LOC131008562`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcriptional regulator SLK2
产物	probable transcriptional regulator SLK2
Arabidopsis	`AT1G43850` (SEU) SEUSS transcriptional co-regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840981] identity=50; qcov=0.354; evalue=3.72e-83; confidence=low
Rice	`Os11g0207000` (OsSEU) - identity=47.6; qcov=0.358; evalue=5.32e-77; confidence=low
GO	GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0005634 (nucleus); GO:0005667 (transcription regulator complex); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF01803 (LIM_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791468.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791468.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791468.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791468.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44376426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:44376491`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B105,B21,B6,C67,D3
`Chr1:44376491`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B105,B21,B6,C67,D3
`Chr1:44376527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B14,B57,C54
`Chr1:44376751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:44376785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:44376797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C16,D4
`Chr1:44377825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:44378174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:44378602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C10,C47,C83
`Chr1:44379018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:44379038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791468.1

773 aa

386

773

LIM_bind

PF01803 LIM_bind 248-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791468.1`	Pfam	`PF01803`	LIM_bind	Family	248	506	1.2e-51	176.3	LIM-domain binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935485.1
TCGGATATGCCCCATTTACCGGCATCAACCGGTCACCCACCCTCCACTCTATTTCTTCCCGCGAACTCACTACAAAACTTCCAAAATACGACGTGGCACTGGGATCTAGGGACTCAATTTCTGAGGATTTCTTGCCACATAACTTTCTGAAGGTGATGGCTTTGGATGCTTTTCTGGATTCCGGCAGCCTACCTATGGCATTGCCTGTTAACGGGGCTGAAGGGATTCTGGAGGCACTAATCTCGGACAGCTCACTCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008562
ATGGCTTTGGATGCTTTTCTGGATTCCGGCAGCCTACCTATGGCATTGCCTGTTAACGGGGCTGAAGGGATTCTGGAGGCACTAATCTCGGACAGCTCACTCAAAAATGAAGAGCATTTCGGTTATATTCTCAGTCTTGTCCAAATAAACCAAAATCCAGGTTCAAATATTCAGAATTCAACAATTCTAGGAAGATCTTCGACTTCAAGAATCGGTATAGGCCATGATGCTGCCGTTGCAGTCGCAAACCCAACTCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791468.1
MALDAFLDSGSLPMALPVNGAEGILEALISDSSLKNEEHFGYILSLVQINQNPGSNIQNSTILGRSSTSRIGIGHDAAVAVANPTLPAGTYLQSHSNTTLEPYISLPVSFPSDDGLVNVSYNCDIFSQLCRAREEESNKQKLEGAVGSTDLCKTKRQCNQNSVPARMQREPGILAPVLKKPRLHVGQGNIQQQQQQESIQELLLKELDCNPQLKKQLPKQKMRILLHDQGNQQETSAPLLDGGICSRRLKQYLYHMRSNT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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