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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004576`

染色体: Chr02 坐标: 68256724-68262307 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004576`
名称	SmilChr02G004576
描述	ARF guanine-nucleotide exchange factor GNL2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68256724 - 68262307 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008564`
GeneID	`131008564`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008564`
原始查询	`LOC131008564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARF guanine-nucleotide exchange factor GNL2
产物	ARF guanine-nucleotide exchange factor GNL2
Arabidopsis	`AT5G19610` (GNL2) GNOM-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832081] identity=62.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0666100` (OsGNOM1) - identity=41.7; qcov=0.851; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0032012 (regulation of ARF protein signal transduction)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01369 (Sec7); PF12783 (Sec7-like_HUS); PF23325 (TPR_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008564

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791469.1`
2	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057791469.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057791469.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791469.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791469.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68257870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:68258088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C26,C76
`Chr2:68258217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,C11,C47,C69
`Chr2:68258919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:68258961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B44,C4,C75,D1
`Chr2:68258979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B41,C86
`Chr2:68259039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B41,B65,C36,C86
`Chr2:68259382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68259642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B44,C4,C75,D1
`Chr2:68259806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:68260152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68260338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791469.1

1365 aa

682

1365

Sec7-like_HUS

Sec7

TPR_28

PF12783 Sec7-like_HUS 242-398 aa PF01369 Sec7 484-669 aa PF23325 TPR_28 1177-1352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791469.1`	Pfam	`PF12783`	Sec7-like_HUS	Repeat	242	398	2.7e-35	122.3	Mon2/Sec7/BIG1-like, HUS domain
`XP_057791469.1`	Pfam	`PF01369`	Sec7	Domain	484	669	2.3e-70	236.7	Sec7 domain
`XP_057791469.1`	Pfam	`PF23325`	TPR_28	Repeat	1177	1352	7.7e-45	153.5	GBF1-like, tetratrico peptide repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935486.1
AATATGATATTTTCAGCGTTAGAAATATTCAATTTTCACTACCTAACATTCTAACCACAAAAATAGATAAATTGACTAAACTTGTTTTCAAACAAGGCTTTAACCTCTTTTGTAGCAACCATTTCGGCTATTTGTCTGACAACAATTCCCAAAAAAATGCCACCCAAATTTACCACTATACCCCGGAATTCCCATGCCCAAACTATGCACAACAGTCCAAGAAAACATCCTAGTTAACTAACATAACAGATTTTTGAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008564
ATGGAAGAAGATGAAAACAAGACATACATGACAAAATCAGAAAGAAAAGATCTGGGGCTCTCCTGCATGCTGAACGCGGAGGTGGGAGCTCTCCTCGCCGTGATCCGCCGCCCACCGGAGTCGAACTACCACCACCCCGACGACACCTGCGACGCTTCCATTCTCCAATCTCTCAAATCCCTCCGAGCCCTTCTCTTCAAGCCTCAACAGGAATGGCGGACGATCGACCCATCAGTCTACATGTCGCCGTTCCTTGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791469.1
MEEDENKTYMTKSERKDLGLSCMLNAEVGALLAVIRRPPESNYHHPDDTCDASILQSLKSLRALLFKPQQEWRTIDPSVYMSPFLDVIQSDDIPASATSAALQSVLKILRLGIFDEKTQGAREAINSAVNAVTSCRLEKTNPVTEDAVMMRILQALTAVMRHRTSILLTDHSTCTLVNTCFQVVQQTANRVDLLQRCARYTMNELIQIIFSRLPDIEVKDWENSESDTEDNDVDSGYGIGSAVDIFHFLCSLLNVVDIMD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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