当前解析结果
SmilChr02G004621| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004621 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004621 |
| 描述 | adenine/guanine permease AZG2 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 68732778 - 68734765 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008584 |
|---|---|
| GeneID | 131008584 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008584 |
| 原始查询 | LOC131008584 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | adenine/guanine permease AZG2 |
| 产物 | adenine/guanine permease AZG2 |
| Arabidopsis | AT5G50300 (AZG2)Xanthine/uracil permease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835095] identity=66.3; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os11g0427700- identity=58.5; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005345 (purine nucleobase transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00860 (Xan_ur_permease) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008584 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057791498.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791498.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791498.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791498.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791498.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:68732990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr2:68733256 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B117,B76,B8,C64,C66 |
Chr2:68733321 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,B52 |
Chr2:68733352 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B104,B129,C49,D7 |
Chr2:68733432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B55 |
Chr2:68733487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr2:68733493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr2:68733807 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr2:68733832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,A3,B58,B82 |
Chr2:68733871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B25 |
Chr2:68734015 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C36 |
Chr2:68734015 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C36 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791498.1PF00860
Xan_ur_permease 97-478 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791498.1 |
Pfam | PF00860 |
Xan_ur_permease | Family | 97 | 478 | 2.9e-24 | 86.2 | Permease family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。