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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004592`

染色体: Chr02 坐标: 68420941-68433107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004592`
名称	SmilChr02G004592
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog D-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68420941 - 68433107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008590`
GeneID	`131008590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008590`
原始查询	`LOC131008590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog D-like
产物	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog D-like
Arabidopsis	`AT1G80810` (AT1G80810) Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844420] identity=40.6; qcov=0.6; evalue=8.22e-53; confidence=medium
Rice	`Os04g0501600` (BIP106) - identity=34; qcov=0.682; evalue=2.45e-37; confidence=low
GO	GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	PF20168 (PDS5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791504.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791504.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791504.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791504.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68421567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C72
`Chr2:68421598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:68421642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B61,B62
`Chr2:68421762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:68421813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:68427696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:68429828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:68429861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B44,C39,D4
`Chr2:68429884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791504.1

418 aa

209

418

PDS5

PF20168 PDS5 34-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791504.1`	Pfam	`PF20168`	PDS5	Repeat	34	240	1.5e-35	123.1	Sister chromatid cohesion protein PDS5 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935521.1
TTCTAACCTCTTAAGTCCTAATTCGCGCCTCCACCCACACTTACAATTAACGTTCTCCCCTCTTCTCCTCTCTGACCCACCCCTGCGCCACCCCGCCGCTCGCCGTCGCGCCGCCCTGTGCGCTTGGAGCAGTCGCGCCGCCTTAACAACTAAAGCCATGATTACTACAAATTCTAGTTCTACATCTTCTTCCACCACATCCCCTGTGGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGAAAGACGATGATGAGTGAAAAGGGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008590
ATGAGTGGTGCTGATGCTCCAGATTCATCAATTGTTGAGAAGTTGAAGAAATTCCTCACGAAGTATGGGACTGAGCTTCTGAAACCCTATGATTTTCCAGAAGAGCTTATGAAAAGACTTGATAAATTGGAGCATCTTTTATCAAATACACTTCAAGGGCATAAGAAACTGGTGGAGACTTTTCTTCAACCATCTAAAGAAGCTCTGATTACTGATGATCTTATGAGGCATTCTCAACTGGATATAAGAGTTTCAGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791504.1
MSGADAPDSSIVEKLKKFLTKYGTELLKPYDFPEELMKRLDKLEHLLSNTLQGHKKLVETFLQPSKEALITDDLMRHSQLDIRVSVASCISQIIRITAPDEPYGEDHMKEFFQIVNSAFERLPCMYGRVYSKAVSILHAMSLSQSCVMMLDLGLYASVGHMFHLFLDGIRTKHPYEVFTSMEKIMTSIIHSNVDNDEFSLVLVKILLNNLRRENQNVAPVSFKLAGNTLKNCSADLKTYVPEAVRSLDVPIEDYAEVVVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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