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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004625`

染色体: Chr02 坐标: 68746029-68748132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004625`
名称	SmilChr02G004625
描述	kirola-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68746029 - 68748132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008615`
GeneID	`131008615`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008615`
原始查询	`LOC131008615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kirola-like
产物	kirola-like
Arabidopsis	`AT1G70880` (AT1G70880) Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843425] identity=35.6; qcov=1.02; evalue=1.87e-21; confidence=medium
Rice	`Os04g0465600` - identity=28.4; qcov=1.06; evalue=1.84e-17; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00407 (Bet_v_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008615

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791536.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791536.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791536.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791536.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68746148`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B103,D4
`Chr2:68746148`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B103,D4
`Chr2:68746190`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B119,B131,B2,B21,B37,B66,B9,C35,C39,C54,C78,C79,D5
`Chr2:68746209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C61,C68
`Chr2:68747784`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B63,B94,B98,D7
`Chr2:68747784`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B63,B94,B98,D7
`Chr2:68747794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B13,B25,B57,C10
`Chr2:68747821`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B66,C78
`Chr2:68747821`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B66,C78
`Chr2:68747944`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A2,A7,B135,B40,C3,C53,D10,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791536.1

146 aa

146

Bet_v_1

PF00407 Bet_v_1 5-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791536.1`	Pfam	`PF00407`	Bet_v_1	Domain	5	146	5.1e-20	72.6	Pathogenesis-related protein Bet v 1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935553.1
ATTTTCCAAATATGAGCTATAGTTTTATGCAATATCACATTAATTTTCTTCTCTTATCTAGAAAAAACAAAAGGCATGGCTCAAATTGCTAAGCTTGAGGCTAAGGCAGAGATTACAAGTCCTCCTGCAAAGGTGTATGATTTCTTCAAATATAACCTAAACAACTTTGTCCATGTGTTCCCACAGGTCTTCAAAAGTGCCAAGTTAATTGAAGGAGAGGAAGGCTGTGCTGGAAATGTCAAGCTCGTCGAATATGTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008615
ATGGCTCAAATTGCTAAGCTTGAGGCTAAGGCAGAGATTACAAGTCCTCCTGCAAAGGTGTATGATTTCTTCAAATATAACCTAAACAACTTTGTCCATGTGTTCCCACAGGTCTTCAAAAGTGCCAAGTTAATTGAAGGAGAGGAAGGCTGTGCTGGAAATGTCAAGCTCGTCGAATATGTACTCGGTAAGGCAATGAGCTTGAAGGTGAAGACTGATGAAATAAATGATGGAGAGAGATCCATGACAATGAGAGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791536.1
MAQIAKLEAKAEITSPPAKVYDFFKYNLNNFVHVFPQVFKSAKLIEGEEGCAGNVKLVEYVLGKAMSLKVKTDEINDGERSMTMRAVEGDILQLYSTFVCKISITDGSVNWSFEFEKNNESAPNPDDYAKLATKLSKVLDLYLLSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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