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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004627`

染色体: Chr02 坐标: 68763865-68767150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004627`
名称	SmilChr02G004627
描述	protein PTST, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68763865 - 68767150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008622`
GeneID	`131008622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008622`
原始查询	`LOC131008622`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PTST, chloroplastic
产物	protein PTST%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G39790` (AT5G39790) PROTEIN TARGETING TO STARCH (PTST) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833975] identity=64.3; qcov=0.541; evalue=3.56e-50; confidence=medium
Rice	`Os02g0135900` - identity=66.9; qcov=0.519; evalue=5.1e-53; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16561 (AMPK1_CBM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791542.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057791542.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057791542.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057791543.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68764119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C18
`Chr2:68764174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B13,B25,B57,C10
`Chr2:68765979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:68766249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr2:68766284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,C33,C6,C81
`Chr2:68766643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B13,B25,B57,C10
`Chr2:68766860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791542.1

283 aa

142

283

AMPK1_CBM

PF16561 AMPK1_CBM 203-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791542.1`	Pfam	`PF16561`	AMPK1_CBM	Family	203	279	3.3e-16	60.0	Glycogen recognition site of AMP-activated protein kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935559.1
TTCTGTGTTGGATAGACCTTTTCCTTTTCTGTAGGTTTTACATGGACTGTTGTTTGATGTCTCCCAATTGTGACACGTGGCAATTTGCCCAATCAAGAGGCCAAAGACCCCGCTCGAGTGCTTCTCTGCCTCCCACTTCCGACGCCTGAGCTTACTCTGTGGAATTAATTTCGAGATATGGCTTGCAATAATATATTCAGCGTTGCGGCGCAACCGTCTATAACCAGGATCCCTACGATGAAAATTGATCAGTCTCAAGT...

XM_057935560.1
GTTTTTTTCTGTGTTGGATAGACCTTTTCCTTTTCTGTAGGTTTTACATGGACTGTTGTTTGATGTCTCCCAATTGTGACACGTGGCAATTTGCCCAATCAAGAGGCCAAAGACCCCGCTCGAGTGCTTCTCTGCCTCCCACTTCCGACGCCTGAGCTTACTCTGTGGAATTAATTTCGAGATATGGCTTGCAATAATATATTCAGCGTTGCGGCGCAACCGTCTATAACCAGGATCCCTACGATGAAAATTGATCAGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008622
ATGGCTTGCAATAATATATTCAGCGTTGCGGCGCAACCGTCTATAACCAGGATCCCTACGATGAAAATTGATCAGTCTCAAGTGGAAATGCCTTGCTTCGTTAAACAGAATCAGGGTTTGATTGTTAAAGGCTCTGTTTATAATCGGCCTACGAAGGTATTCTGCAATGCTGCTAGTTTGGAGGAGGAATTCTCAGCAATACAATCCAAGAATTTCTCCAAGGATGAGGAATCTGATGTCGAGGCTTTGCCGGAAGAGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791542.1
MACNNIFSVAAQPSITRIPTMKIDQSQVEMPCFVKQNQGLIVKGSVYNRPTKVFCNAASLEEEFSAIQSKNFSKDEESDVEALPEETVLPSSEELKALLADSQRAALVKKLSEANQQNRFLKRQLQVKEDELVDFKSELAVMDIEVQALLHLAEEIANYDIPEGSRKINGKYIQSHLLLKLEAIQKRLAKQIKDVDAAQPQEVHLIWYGMAESVQVMGSFDGWSEGEHLSPEYAGSYTKFLTTLMLRPGRYEIKFLVDGE...

XP_057791543.1
MACNNIFSVAAQPSITRIPTMKIDQSQVEMPCFVKQNQGLIVKGSVYNRPTKVFCNAASLEEEFSAIQSKNFSKDEESDVEALPEETVLPSSEELKALLADSQRAALVKKLSEANQQNRFLKRQLQVKEDELVDFKSELAVMDIEVQALLHLAEEIANYDIPEGSRKINGKYIQSHLLLKLEAIQKRLAKQIKDVDAAQPQEVHLIWYGMAEARKHYLLTSSRNINNMFHTLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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