当前解析结果
SmilChr02G004631| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004631 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004631 |
| 描述 | bet1-like protein At4g14600 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 68787451 - 68789667 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008626 |
|---|---|
| GeneID | 131008626 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008626 |
| 原始查询 | LOC131008626 |
| 来源 | GFF basic annotation; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | bet1-like protein At4g14600 |
| 产物 | bet1-like protein At4g14600 |
| Arabidopsis | AT4G14600 (AT4G14600)Target SNARE coiled-coil domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827108] identity=61.8; qcov=1.02; evalue=3.43e-51; confidence=high |
| Rice | Os07g0577900- identity=63.7; qcov=1.02; evalue=2.85e-50; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008626 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057791548.1 |
| 2 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.60000 | XP_057791548.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057791548.1 |
| 4 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057791548.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791548.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:68787977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,B70 |
Chr2:68787990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr2:68788017 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B133,B70 |
Chr2:68788017 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,B70 |
Chr2:68788022 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr2:68788043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。