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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004640`

染色体: Chr02 坐标: 68857442-68859086 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004640`
名称	SmilChr02G004640
描述	protein ATAF2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68857442 - 68859086 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008633`
GeneID	`131008633`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008633`
原始查询	`LOC131008633`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ATAF2-like
产物	protein ATAF2-like
Arabidopsis	`AT5G08790` (ATAF2) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830779] identity=63.1; qcov=0.986; evalue=1.44e-114; confidence=high
Rice	`Os01g0884300` (OsNAC6) - identity=66.3; qcov=0.922; evalue=4.01e-109; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008633

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791557.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791557.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791557.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791557.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68857684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,D6
`Chr2:68857740`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A15,A21,A22,A24,A6,A8,B100,B101,B105,B106,B11,B112,B113,B114,B12,B123,B129,B134,B14,B21,B28,B33,B35,B4,B40,B50,B53,B54,B56,B59,B62,B86,B90,B91,B93,C10,C14,C2,C20,C26,C29,C32,C4,C45,C56,C60,C63,C68,C70,C76,C78,C8,C82,D10,D2,D5
`Chr2:68857743`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	45	A15,A21,A22,A24,A8,B100,B101,B106,B11,B112,B113,B114,B12,B129,B134,B14,B21,B35,B4,B40,B50,B53,B56,B62,B86,B90,B91,B93,C14,C2,C20,C26,C29,C32,C4,C45,C56,C60,C63,C68,C70,C8,C82,D10,D2
`Chr2:68857756`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C32
`Chr2:68857756`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C32
`Chr2:68857765`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C32
`Chr2:68857765`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C32
`Chr2:68858156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B56,C2
`Chr2:68858246`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C58,C60
`Chr2:68858246`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C58,C60
`Chr2:68858471`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A21,A23,B119,B124,B32,B36,B38,B43,B48,B68,B91,C31,C39,C87
`Chr2:68858475`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A21,A23,B119,B120,B124,B32,B36,B38,B43,B48,B68,B91,C31,C39,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791557.1

283 aa

142

283

NAM

PF02365 NAM 11-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791557.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	11	134	1.1e-47	162.2	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935574.1
TCCCTAACTAAAACAAAAAAAAAGTAGTAAAATAAAAAAAATAAAGGAAAAGAAAACCTTGCTCCCCAATCCCCACTGCCCCCACCACTCTCTTGTTTATGTCTATAAATAGGTAGATCGGTGGTAGCGCTCTTCGTTTGAGAGCGAAAAGTTTAGGAAAAGTGCAATATCCGATTCCAAGTGAGAGTACAGTGAAGTGAGAGAAAGTGAATGAAGGGTGGTGATGAGCAGTTGAATTTGCCGGCGGGGTTCAGGTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008633
ATGAAGGGTGGTGATGAGCAGTTGAATTTGCCGGCGGGGTTCAGGTTCCATCCGACGGACGAGGAGCTCGTGGTTCACTACCTCTGCCGCCGCTGCGCCGGCCAGAATATTGATGTTCCCATCATAGCTGAGATCGATCTCTACAAGTTCGATCCCTGGCAACTTCCTGGCATGTCGCTATACGGTGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTCTCCAAGAGACCGCAAGTACCCGAACGGTTCACGGCCGAACCGGGCGGCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791557.1
MKGGDEQLNLPAGFRFHPTDEELVVHYLCRRCAGQNIDVPIIAEIDLYKFDPWQLPGMSLYGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRAAGTGYWKATGADKPVGKPKTLGIKKALVFYAGKAPGGIKTNWIMHEYRLANVDRSASASAKRSNLRLDDWVLCRIYNKKGTLEKHCNVDHQEAVQFSDCEEQKPNVNAFPLQSFANDFDVSIPKLHTYSSSSEHVLSSPELKEVQSEAKWSEFENGSDFQLNYTDFGFQDDPFGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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