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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004644`

染色体: Chr02 坐标: 68878194-68880713 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004644`
名称	SmilChr02G004644
描述	RNA polymerase II transcriptional coactivator KIWI-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68878194 - 68880713 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008636`
GeneID	`131008636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008636`
原始查询	`LOC131008636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase II transcriptional coactivator KIWI-like
产物	RNA polymerase II transcriptional coactivator KIWI-like
Arabidopsis	`AT5G09250` (KIWI) ssDNA-binding transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830784] identity=60.6; qcov=1.02; evalue=2.56e-37; confidence=medium
Rice	`Os02g0553600` (SI1) - identity=52.4; qcov=1.01; evalue=9.33e-31; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005667 (transcription regulator complex); GO:0060261 (positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF02229 (PC4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791562.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057791562.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791562.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791562.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68880420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B23,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791562.1

102 aa

102

PC4

PF02229 PC4 40-91 aa

XP_057791563.1

102 aa

102

PC4

PF02229 PC4 40-91 aa

XP_057791564.1

102 aa

102

PC4

PF02229 PC4 40-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791562.1`	Pfam	`PF02229`	PC4	Domain	40	91	3.7e-25	87.9	Transcriptional Coactivator p15 (PC4)
`XP_057791563.1`	Pfam	`PF02229`	PC4	Domain	40	91	3.7e-25	87.9	Transcriptional Coactivator p15 (PC4)
`XP_057791564.1`	Pfam	`PF02229`	PC4	Domain	40	91	3.7e-25	87.9	Transcriptional Coactivator p15 (PC4)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935581.1
AGTTTTCAAGCGGTATGCACATACGTTGAAATAAAAGCCCTAAGCAAACATTCCAATTTCCCCCCAAACCCTTCCGGCTATCAGTCTGCAGTGCACAGCGATAAGTAGAAATGTCGAAGAGGGGCAAGAAGAGGGAGGATGAAGACGCGCTCTCCGAAGGCGACGAGCCTCCGAAGAAGACATTGAAGGCCGACAACGATTCAGATGACTCTGATCAAATCGTTGTATGCGAGTTGTCGAAGAATCGAAAAGTGTCGGTG...

XM_057935579.1
TGCAGTGCACAGCGGTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGACACACAGCACGGACTGAGGGTTTTCTCTCACAAATATAAGTAGAAATGTCGAAGAGGGGCAAGAAGAGGGAGGATGAAGACGCGCTCTCCGAAGGCGACGAGCCTCCGAAGAAGACATTGAAGGCCGACAACGATTCAGATGACTCTGATCAAATCGTTGTATGCGAGTTGTCGAAGAATCGAAAAGTGTCGGTGAGGAACT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131008636
ATGTCGAAGAGGGGCAAGAAGAGGGAGGATGAAGACGCGCTCTCCGAAGGCGACGAGCCTCCGAAGAAGACATTGAAGGCCGACAACGATTCAGATGACTCTGATCAAATCGTTGTATGCGAGTTGTCGAAGAATCGAAAAGTGTCGGTGAGGAACTGGCATGGAAAGGTTGTGGTGGATATCAGGGAATTCTATTCTAAAGACGGCAAGGAATTTCCTGGCAAGAAAGGTATCTCATTGTCAATGGACCAGTGGAAAAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057791562.1
MSKRGKKREDEDALSEGDEPPKKTLKADNDSDDSDQIVVCELSKNRKVSVRNWHGKVVVDIREFYSKDGKEFPGKKGISLSMDQWKILRDHVDEIDKEVENT

XP_057791563.1
MSKRGKKREDEDALSEGDEPPKKTLKADNDSDDSDQIVVCELSKNRKVSVRNWHGKVVVDIREFYSKDGKEFPGKKGISLSMDQWKILRDHVDEIDKEVENT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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