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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004645`

染色体: Chr02 坐标: 68887366-68896299 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004645`
名称	SmilChr02G004645
描述	uncharacterized SmilChr02G004645
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68887366 - 68896299 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008638`
GeneID	`131008638`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008638`
原始查询	`LOC131008638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818040]; symbol=AT2G34750; hit=AT2G34750; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818040]; symbol=AT2G34750; hit=AT2G34750; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G34750` (AT2G34750) RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818040] identity=47.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0688100` (P0661G04.7-1) - identity=43.1; qcov=0.953; evalue=3.88e-155; confidence=medium
GO	GO:0001042 (RNA polymerase I core binding); GO:0001181 (RNA polymerase I general transcription initiation factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006361 (transcription initiation at RNA polymerase I promoter)
KEGG	-
Pfam	PF05327 (RRN3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008638

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791565.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791565.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791565.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791565.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791565.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68888794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B52,C48
`Chr2:68888830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B24
`Chr2:68888928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:68888978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B91
`Chr2:68888998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B8,B95,C69
`Chr2:68889130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:68889517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr2:68889618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:68889635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,C45,C64,C66,C83
`Chr2:68890423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B40,B45,B61
`Chr2:68890453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B91
`Chr2:68890629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,C45,C64,C66,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791565.1

620 aa

310

620

RRN3

PF05327 RRN3 11-534 aa

XP_057791566.1

620 aa

310

620

RRN3

PF05327 RRN3 11-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791565.1`	Pfam	`PF05327`	RRN3	Repeat	11	534	1.4e-114	384.4	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3
`XP_057791566.1`	Pfam	`PF05327`	RRN3	Repeat	11	534	1.4e-114	384.4	RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935583.1
GTTCCAGCCGCCTCCCATCCCCGCCTTCCTGTTCTGTTCCACCCCTCCTCCACGGTTCCCTCCGGCCTCCCATCCCCGCCTCCCACCGGCACCGGCGCCGCTGCCTCTCCCACCGGCGCCTCCCTCCCTTTCTCCAGTCCGACAGTCCCAGCTGCAGCAGTACAGCTCGTCCCAGGCTCCCAGCAGCAGCAGCGCTCGTCCGGTCGTCCCCTTGCACCAGCGCCTTCTCCGCCTTGTTTCTCCCTACGCCTTAGCCGCCT...

XM_057935582.1
GTTCCAGCCGCCTCCCATCCCCGCCTTCCTGTTCTGTTCCACCCCTCCTCCACGGTTCCCTCCGGCCTCCCATCCCCGCCTCCCACCGGCACCGGCGCCGCTGCCTCTCCCACCGGCGCCTCCCTCCCTTTCTCCAGTCCGACAGTCCCAGCTGCAGCAGTACAGCTCGTCCCAGGCTCCCAGCAGCAGCAGCGCTCGTCCGGTCGTCCCCTTGCACCAGCGCCTTCTCCGCCTTGTTTCTCCCTACGCCTTAGCCGCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008638
ATGGGAGCGCCTTACATGGATGAACTAAGTTTCACTGATTCTGAGCTAGATCATCATGTTAGGAATGCCCTCAAAGCTGCTATTCAGGGCGACTGCAACTTTTATAACCAGCTTGTGGCAGTGATACACCATAAAGAACGTCTTGTTACTGAAGAGGTGGCCCTTCTTGTGACATGTTTAAAAGCTGTGACGGGAGCAGTCTCATGTGTACACATTGTTCATCATCGGTCTCTACTTGCTGCTATACTAGGGATGAGCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791565.1
MGAPYMDELSFTDSELDHHVRNALKAAIQGDCNFYNQLVAVIHHKERLVTEEVALLVTCLKAVTGAVSCVHIVHHRSLLAAILGMSLWDYGTDVMDALIELLIALASSNGDYVDLCLEMLVMNFMPPPAASYFVELLKQPRGLAKKIQVLDRVHSTLKDISNLVPLTPLRLEKIVRDRMPPIYAKEPFIVMYAENILRLESGTMGELVGSTGLVALMDKLIELDVEISWEDILQDDFHKGMFDIELEDLESPADPIEQDG...

XP_057791566.1
MGAPYMDELSFTDSELDHHVRNALKAAIQGDCNFYNQLVAVIHHKERLVTEEVALLVTCLKAVTGAVSCVHIVHHRSLLAAILGMSLWDYGTDVMDALIELLIALASSNGDYVDLCLEMLVMNFMPPPAASYFVELLKQPRGLAKKIQVLDRVHSTLKDISNLVPLTPLRLEKIVRDRMPPIYAKEPFIVMYAENILRLESGTMGELVGSTGLVALMDKLIELDVEISWEDILQDDFHKGMFDIELEDLESPADPIEQDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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