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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002674`

染色体: Chr01 坐标: 44955095-44955667 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002674`
名称	SmilChr01G002674
描述	uncharacterized SmilChr01G002674
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44955095 - 44955667 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008672`
GeneID	`131008672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008672`
原始查询	`LOC131008672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=23.4; qcov=1.06; evalue=1.12e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791628.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791628.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791628.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791628.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44955177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:44955179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:44955182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:44955196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B128,C41,C87
`Chr1:44955245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C78
`Chr1:44955245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:44955251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B123
`Chr1:44955289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C12,C57
`Chr1:44955470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C28,C59
`Chr1:44955470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C59
`Chr1:44955472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,D1
`Chr1:44955484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791628.1

190 aa

190

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 56-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791628.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	56	189	5.7e-14	52.9	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935645.1
ATGTCGAATTTGTCACTGAAATGTTTGATAGAAACAAACAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGGCTAGAGAAGATTGAGTATGTCTTGGACAACCCAATCACTGTCATTCCTGACAAGCAGTCTGCTGAGTATGCATCATTTGATGAAGCTGCTCACAAGAAGCATGTCGAGGATGCAACATCGGCACAATGTGTGATGTTGTCCTCTATGACTACAGAGTTACAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008672
ATGTCGAATTTGTCACTGAAATGTTTGATAGAAACAAACAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGGCTAGAGAAGATTGAGTATGTCTTGGACAACCCAATCACTGTCATTCCTGACAAGCAGTCTGCTGAGTATGCATCATTTGATGAAGCTGCTCACAAGAAGCATGTCGAGGATGCAACATCGGCACAATGTGTGATGTTGTCCTCTATGACTACAGAGTTACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791628.1
MSNLSLKCLIETNKLTGSNFTDWLRCLRLVLRLEKIEYVLDNPITVIPDKQSAEYASFDEAAHKKHVEDATSAQCVMLSSMTTELQRQHEHMFPYDMLKHLKSLYASEAQTMEYEILRDLFKCKLQEGSPVSDHVLKMIGLIERLASIGTMLPATVSVNLILQSLPASFENFIVNFNMNGTKASLPELHN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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