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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004776`

染色体: Chr02 坐标: 69911102-69916141 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004776`
名称	SmilChr02G004776
描述	uncharacterized SmilChr02G004776
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69911102 - 69916141 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008673`
GeneID	`131008673`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008673`
原始查询	`LOC131008673`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsRFP; symbol=OsRFP; hit=Os06g0283200; species=rice; confidence=medium
产物	OsRFP; symbol=OsRFP; hit=Os06g0283200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G05670` (AT3G05670) RING/U-box protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819734] identity=47.4; qcov=0.246; evalue=4.56e-43; confidence=weak
Rice	`Os06g0283200` (OsRFP) - identity=38; qcov=0.535; evalue=1.65e-61; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791625.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791625.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791625.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791625.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69911259`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A19,B111,B33,B44,B45,C30
`Chr2:69911266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C17,D10
`Chr2:69911358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B130,B66,B91,C33
`Chr2:69911371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C21,C8
`Chr2:69911436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B29,B55,C37
`Chr2:69911502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B80,C17,C83,D10,D3
`Chr2:69911526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:69911553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:69911575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B29,B55,C37
`Chr2:69911619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:69914107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:69914188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791625.1

694 aa

347

694

PHD

PF00628 PHD 176-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791625.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	176	219	1.4e-08	35.3	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935642.1
GAATAAATTTTATATTATAACTATAAAAATAATATAAAATAATTATAAATAATAATTTAACGTGATTCCAGTATACGCGCACACAGTAGCGTAGATATAACATGAAATTGATATTATTAAAAAAAAAAAATTACCGTAGATGGTGCGGCGACACACTTGCGGATCGGTGCCCCAACGTAAATAACAGAAGCTTTGATTTTGCCGCTGAATCGCCAATGGCCACACACATGCCCTCCTCTTCCCCAAACAAACGTCTCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008673
ATGAAATTGATATTATTAAAAAAAAAAAATTACCGTAGATGGTGCGGCGACACACTTGCGGATCGGTGCCCCAACGTAAATAACAGAAGCTTTGATTTTGCCGCTGAATCGCCAATGGCCACACACATGCCCTCCTCTTCCCCAAACAAACGTCTCAAAACCCTATCCCCAATTTCCCAATCCCCCATCCGAAAAGGCAAATCCATAGCCGAAGAGGAACCGCCGCCGCCGGTCGCCCAAGATGAAGCTGCCGATTGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791625.1
MKLILLKKKNYRRWCGDTLADRCPNVNNRSFDFAAESPMATHMPSSSPNKRLKTLSPISQSPIRKGKSIAEEEPPPPVAQDEAADCCGICLSEAGVSRGHIECCDHYYCFVCIMEWAKVESKCPLCKRRFSTITRPPKPPVFPSERVVHVPLRDQACHYFGTATNGHSDMYAEAKCAICQGMADESFLLLCDLCDSAAHTYCVGLGYTVPEGDWFCLDCTLLRDEHLKSESSIDSDVQTSLSSVDKISTSEHISILDIVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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