当前解析结果
SmilChr02G004731| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004731 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004731 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004731 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69551777 - 69558821 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008678 |
|---|---|
| GeneID | 131008678 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008678 |
| 原始查询 | LOC131008678 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03023 (MurJ) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008678 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057791637.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057791637.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057791641.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.20000 | XP_057791639.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057791641.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69552222 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C70 |
Chr2:69552239 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr2:69552308 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr2:69552313 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B70 |
Chr2:69553289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr2:69554674 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr2:69555045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B115,B48,B89,C87 |
Chr2:69555064 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B61,C43,C49 |
Chr2:69555068 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,C71 |
Chr2:69555190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C83 |
Chr2:69555879 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr2:69555942 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791637.1PF03023
MurJ 103-532 aa
XP_057791638.1PF03023
MurJ 103-532 aa
XP_057791639.1PF03023
MurJ 103-516 aa
XP_057791640.1PF03023
MurJ 103-545 aa
XP_057791641.1PF03023
MurJ 8-392 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791637.1 |
Pfam | PF03023 |
MurJ | Family | 103 | 532 | 8.6e-61 | 206.6 | Lipid II flippase MurJ |
XP_057791638.1 |
Pfam | PF03023 |
MurJ | Family | 103 | 532 | 8.6e-61 | 206.6 | Lipid II flippase MurJ |
XP_057791639.1 |
Pfam | PF03023 |
MurJ | Family | 103 | 516 | 2.4e-53 | 182.1 | Lipid II flippase MurJ |
XP_057791640.1 |
Pfam | PF03023 |
MurJ | Family | 103 | 545 | 3.9e-61 | 207.8 | Lipid II flippase MurJ |
XP_057791641.1 |
Pfam | PF03023 |
MurJ | Family | 8 | 392 | 8.3e-55 | 186.9 | Lipid II flippase MurJ |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。