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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004747`

染色体: Chr02 坐标: 69674212-69679613 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004747`
名称	SmilChr02G004747
描述	DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69674212 - 69679613 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008681`
GeneID	`131008681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008681`
原始查询	`LOC131008681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM2
产物	DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM2
Arabidopsis	`AT5G14620` (DRM2) domains rearranged methyltransferase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831315] identity=55.5; qcov=0.955; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0110800` (DRM2) - identity=49.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003886 (DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006306 (GO:0006306)
KEGG	-
Pfam	PF00145 (DNA_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791651.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791651.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791651.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791651.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69674353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr2:69674484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:69674499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B84,D11
`Chr2:69674640`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B119,B126,C50,C70
`Chr2:69674640`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B119,B126,C50,C70
`Chr2:69674672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B123,B48,C35
`Chr2:69675061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:69675276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B35,B64
`Chr2:69675363`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A10,A11,A13,A18,A21,A25,A3,A6,A9,B100,B104,B11,B119,B123,B126,B134,B137,B140,B16,B21,B29,B31,B33,B35,B42,B44,B45,B47,B48,B5,B6,B61,B64,B65,B68,B69,B73,B87,B9,C3,C31,C34,C35,C37,C38,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C50,C52,C63,C67,C70,C71,C77,C82,C85,D6
`Chr2:69675454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:69675534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr2:69676427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791651.1

600 aa

300

600

DNA_methylase

PF00145 DNA_methylase 474-589 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791651.1`	Pfam	`PF00145`	DNA_methylase	Domain	474	589	6.1e-14	52.9	C-5 cytosine-specific DNA methylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935668.1
ATTTGGTTCATATCTATTTATTCATTCTTTATTGTTTTTGACCTTGGCGCGTGGGTTTCAAAATATTTGTACATAAACAATTATTCTGTTTTCTTAGGCGCACAAGGAAGTGGTGGGAGGAATCTCTCTTTCTTTCATCTTCTATTTTTTCGTTTCATAATTTCGCTACTGATTTTATTCCTCCCCAATTCTGCGCTCAATTCTCTAATTCAGTTTCGTTAGATTCTCTCTCAGTCCCGATTTTACAGAGAAATTCTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008681
ATGGATGAAAATGTATCTGGAGGAGATGTTTCTGATGTTGATTGGACGACAGATGACGAGTCAGAGATTAATTTGAACCCCGTTACTACTATTGTTGGCAATGAGGAGGCTTGCTCCTCAAGAAGTGCTTCCCGTTCCAAGATGTTTGATCATTTTGTTGGAATGGGTTTTTCGGATAAATTGGTTTCAAAAGCCATTGAGGAAAATGGAGAAGAAGATTCAGACTCAATACTGAACTGGCTCTTAACATTCTCGAGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791651.1
MDENVSGGDVSDVDWTTDDESEINLNPVTTIVGNEEACSSRSASRSKMFDHFVGMGFSDKLVSKAIEENGEEDSDSILNWLLTFSSLEDSPPQQLSTNFDPCSSDYNEIFPNDLSDMDSWSDDEIEDCLKPNGAPNGAANGVYRSEKHKMLLSLAASGSLTEREEKLLSLADMGYPLEEAEIALERCGPKALIGELSDFLCAAQMAREEDCYLPDDDLKPKHLLSGSSKSKKRKFLEMKKNVIEESIRLPNPMIGYGVPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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