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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004678`

染色体: Chr02 坐标: 69116334-69125127 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004678`
名称	SmilChr02G004678
描述	O-fucosyltransferase 38
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69116334 - 69125127 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008692`
GeneID	`131008692`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008692`
原始查询	`LOC131008692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-fucosyltransferase 38
产物	O-fucosyltransferase 38
Arabidopsis	`AT5G64600` (AT5G64600) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836581] identity=67.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0190100` - identity=71.8; qcov=0.844; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008692

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057791683.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791683.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791683.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791683.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69116589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C17,C61,C72
`Chr2:69118612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:69118651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:69119287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:69119326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:69120276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:69121037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C6,D3
`Chr2:69121042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:69122048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:69124082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr2:69124097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B70,B82
`Chr2:69124736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791683.1

493 aa

246

493

O-FucT

PF10250 O-FucT 98-413 aa

XP_057791684.1

424 aa

212

424

O-FucT

PF10250 O-FucT 98-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791683.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	98	413	1.7e-105	354.2	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057791684.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	98	413	1.1e-105	354.8	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935700.1
AAAACATTTTGAGCAAACTATGCTAAAAGCCTAAAACAGTGAACCTGAATACCTGACTCAACAACCCAGGGACTCAACTGGGTGAAAAGTGAAAAATGTTTCTCACATTCACATAGAACCTTCAACGCACATATTTTATTAAAAAACACCGAATTTCTCGAAAGCGGGTTATGATTGAATTCGTTGCATTGTGAGCAATTTGAAACAGAGATCTACCGATGAGTGCAAAGAATGGTTAATCACCGAGGGCATCATCACCT...

XM_057935701.1
GCCTAAAACAGTGAACCTGAATACCTGACTCAACAACCCAGGGACTCAACTGGGTGAAAAGTGAAAAATGTTTCTCACATTCACATAGAACCTTCAACGCACATATTTTATTAAAAAACACCGAATTTCTCGAAAGCGGGTTATGATTGAATTCGTTGCATTGTGAGCAATTTGAAACAGAGATCTACCGATGAGTGCAAAGAATGGTTAATCACCGAGGGCATCATCACCTTTCATCATCCAGAAACAGAAAATCTTCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008692
ATGGTTAATCACCGAGGGCATCATCACCTTTCATCATCCAGAAACAGAAAATCTTCCTTCTTTTCAATAACCTTGTACGTGATCCTCATTTTTGCTCTCTCAATCTTCACTTTCATGCTGTACAGCAAAGATGTGTTGGAAGACGAAAATAAGATGCCGCTTCTTAGAGTTGAGAAGCCCAAAATTAACAAGTTATTAGATGATAAACTTTGGGAAACTCCTTCTAGTCTTGGTTTGCAGCAGTGTGTCGAGCCAACAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791683.1
MVNHRGHHHLSSSRNRKSSFFSITLYVILIFALSIFTFMLYSKDVLEDENKMPLLRVEKPKINKLLDDKLWETPSSLGLQQCVEPTSKYRDTPVWDHYMTVKSNGGLNQMRIGIADMVAVARIMNATLVIPQLDKSSFWQDSSTFSNIFDELHFIKSLEKDVRIVKELPKEVESLPRARKHFTSWAGLSYYEEMTALWKEYQVIHVAKSDSRLANNDLPLDIQRLRCRALYHALRFSPSIESLGKKLVERLRSRAQRYIA...

XP_057791684.1
MVNHRGHHHLSSSRNRKSSFFSITLYVILIFALSIFTFMLYSKDVLEDENKMPLLRVEKPKINKLLDDKLWETPSSLGLQQCVEPTSKYRDTPVWDHYMTVKSNGGLNQMRIGIADMVAVARIMNATLVIPQLDKSSFWQDSSTFSNIFDELHFIKSLEKDVRIVKELPKEVESLPRARKHFTSWAGLSYYEEMTALWKEYQVIHVAKSDSRLANNDLPLDIQRLRCRALYHALRFSPSIESLGKKLVERLRSRAQRYIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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