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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004679`

染色体: Chr02 坐标: 69130958-69133135 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004679`
名称	SmilChr02G004679
描述	protein PIN-LIKES 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69130958 - 69133135 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008700`
GeneID	`131008700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008700`
原始查询	`LOC131008700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PIN-LIKES 2-like
产物	protein PIN-LIKES 2-like
Arabidopsis	`AT1G71090` (AT1G71090) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843449] identity=61.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0191000` (OsPILS2) - identity=62.5; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0080162 (endoplasmic reticulum to cytosol auxin transport)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057791694.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057791694.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057791694.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057791694.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69131047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B8
`Chr2:69131182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:69131188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B68,C1,C62,C86
`Chr2:69131201`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr2:69131201`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr2:69131230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B20,B84
`Chr2:69131316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85
`Chr2:69131366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C33
`Chr2:69131389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:69131425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:69131487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B52,C48
`Chr2:69131500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791694.1

440 aa

220

440

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 17-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791694.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	17	428	7.9e-82	275.3	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935711.1
CTAAAATCCATTTTGACTTCGTATTATTACGACAAATTAAGACAAGATTATTAAAGAAATTCGAAGATGCCATTTCCAGAAAGATCTCGCTATAACTGCATTTATACATGATGACGTGCGCCAACCACTTCCTTCACTTCCTCTCAGTTACGTCTTCTCTATCTCTCTCTCGCGCTTTCTCTCTCATTACAGGATTTACTTGACCCATATATCTCTCTCCTCTTCAATTTGTTGAAGGCATTCCGTTTCTCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008700
ATGGAGTCAGTTGGTGGTGAAGCAAGTTGGGTTGGAAACGCAATTCACTCGGTGATTCCGCTGTTGAAGCTCATCACTCTCACCGTGATCGGATCAGTCCTCGCCCACCCCAAAACGCAGCTCATTCCAAAAGCTGCTTTCAAGCTTCTAAGCAGGCTCGTTTTCATGCTCTTCTTGCCATGTATGATCTTCATCAATCTCGGCGAGACCATAACCGTCGACAATTTCATCCGCTGGTGGTTCATACCGCTCAATGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791694.1
MESVGGEASWVGNAIHSVIPLLKLITLTVIGSVLAHPKTQLIPKAAFKLLSRLVFMLFLPCMIFINLGETITVDNFIRWWFIPLNVIISTAAGCVLGLLVAGICRPPPEFFRLTVIMTAFGNTGNLPLAIVASVCHDDGSPFGPECENKGTAYVSFAQWVAVLLVYTLVYHMMEPTASDFHEGVEIGGEIEEHLPTNILSRPLLVEAEWPGLEDRATEHCKTPLIARVFAAEHDDDLEEEASCSSPKSVKCFAEPGIVTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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