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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004761`

染色体: Chr02 坐标: 69794445-69798990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004761`
名称	SmilChr02G004761
描述	protease Do-like 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69794445 - 69798990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008701`
GeneID	`131008701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008701`
原始查询	`LOC131008701`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protease Do-like 1, chloroplastic
产物	protease Do-like 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G27925` (DEG1) DegP protease 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822416] identity=88.7; qcov=0.844; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0568900` (OsDegp9) - identity=88.8; qcov=0.809; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00089 (Trypsin); PF13180 (PDZ_2); PF13365 (Trypsin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791695.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057791695.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057791695.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791695.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69794648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:69795473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B71,C48,C62,D5
`Chr2:69795710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C44,C49,C50
`Chr2:69796009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:69797848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C30
`Chr2:69797889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr2:69798559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:69798748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791695.1

430 aa

215

430

Trypsin_2

Trypsin

PDZ_2

PF13365 Trypsin_2 148-287 aa PF00089 Trypsin 149-310 aa PF13180 PDZ_2 326-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791695.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	148	287	2.5e-36	126.3	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057791695.1`	Pfam	`PF00089`	Trypsin	Domain	149	310	5e-19	69.7	Trypsin
`XP_057791695.1`	Pfam	`PF13180`	PDZ_2	Domain	326	421	9.4e-14	52.2	PDZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935712.1
TTTCATCTTACAAGGCCGAAAATTAATGCACCCAACTACTTACAATTTACAAAACTCTATAAACCATTTTCAAATAACCCACGGAATAAACACATCCACAAAAATTATAGAGAGAGAAACCAAGCGTAGAAATAATTTGACCAATTACTGAATTCCAACTCCCTCTCTCCACTCCTCAATGGCTGCACTCGCTTCCACGTTCTTCGCCATCACTCCGAAAGCATCGCGCTCGAATTCAATCCCCAAATTACCGCTCGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008701
ATGGCTGCACTCGCTTCCACGTTCTTCGCCATCACTCCGAAAGCATCGCGCTCGAATTCAATCCCCAAATTACCGCTCGCGAGATCCCTGTCTCAGTTCAATCGAGCTACTTTGATCACTCCGATCATCGTTTCCGCTTTCCGCGACAAGTTTGTTCCGAGCAATTCCACCTCGGAGCTCGGTTCCAGCAATGGGCTGAAGAAGCTCGTGGACTCGCTGTTCGTGCTCTGCACTTCGGTCGCTCTCTCGGCGACGCTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791695.1
MAALASTFFAITPKASRSNSIPKLPLARSLSQFNRATLITPIIVSAFRDKFVPSNSTSELGSSNGLKKLVDSLFVLCTSVALSATLFVADVDSASAFVVTTPRKLQSDELATVRLFQENTPSVVYITNLAARQDAFTLDVLEVPQGSGSGFVWDTQGHVVTNYHVIRGASDLKVTLADQSTYDAKVVGFDQDKDVAVLSIEAPKGKLRPIPIGVSADLLVGQKVYAIGNPFGLDHTLTTGVISGLRREISSAATGRPIQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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