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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004735`

染色体: Chr02 坐标: 69579010-69580653 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004735`
名称	SmilChr02G004735
描述	U-box domain-containing protein 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69579010 - 69580653 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008718`
GeneID	`131008718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008718`
原始查询	`LOC131008718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 4
产物	U-box domain-containing protein 4
Arabidopsis	`AT5G14510` (AT5G14510) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831302] identity=49.9; qcov=1.01; evalue=6.48e-96; confidence=high
Rice	`Os01g0112500` - identity=40.4; qcov=0.964; evalue=4.34e-49; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791716.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791716.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791716.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791716.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69579372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:69579418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,C63,C71,D2
`Chr2:69579640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85
`Chr2:69579906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:69580153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:69580163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:69580169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D4
`Chr2:69580210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:69580303`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C21
`Chr2:69580303`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C21
`Chr2:69580356`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	120	A1,A11,A13,A14,A16,A2,A21,A23,A24,A3,A8,B1,B10,B100,B102,B103,B108,B109,B114,B120,B121,B124,B126,B128,B136,B16,B18,B2,B20,B22,B23,B25,B3,B36,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B52,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B68,B70,B77,B78,B79,B8,B80,B83,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B98,C10,C11,C14,C15,C17,C18,C19,C20,C21,C23,C25,C3,C31,C32,C35,C38,C4,C40,C43,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C57,C6,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C73,C75,C77,C78,C8,C80,C82,C85,C9,D1,D2,D3,D6,D8,D9
`Chr2:69580358`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	92	A1,A11,A13,A14,A16,A21,A23,A24,A3,A8,B10,B100,B102,B103,B114,B120,B121,B124,B126,B18,B20,B22,B23,B3,B36,B42,B43,B45,B47,B49,B52,B55,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B70,B77,B78,B79,B8,B80,B89,B91,B98,C11,C14,C15,C17,C18,C21,C23,C3,C31,C32,C35,C38,C4,C43,C44,C46,C47,C49,C50,C55,C56,C57,C6,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C73,C75,C77,C8,C80,C82,C85,C9,D1,D2,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791716.1

334 aa

167

334

ARM_PUB

PF25598 ARM_PUB 124-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791716.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	124	285	2.9e-15	57.2	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935733.1
TAATTTGTATATAGAGAGAGAAGGAGAAAGATTGAAAGAAAGGCAATTCCCACTTAAGGTAGTTACAAAAGATAAACGAGGGAAAGGGCATAGTCCATTGCTTCCAACTCAAACAATACAAATTTATTTTTAAAAACCAAAAAGCCACAAACCAGAAAAAGCACCAAAAATCAAGCACCTTGCATCGTCTTCAAGCAATCACTCTATTCATTATCACAATCTTACATATACTAACCACATTTTCATGTTTTCAAAGACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008718
ATGGAGTCAGCCATGGCGGAAGCCCTTCTATACGGCCAAACTGAAGCTCAGATTGCCGCGGCCAGAGCGATTGGGAAGCTCGACACAATGCAGAAGAAAAGGCTAGCTGAAAGTGGAGCCATTTCTCCCCTGATTATGATGCTCCACGCCCAGGACTATGAATCAATTGAGGCTTCTCTGTTTGCTCTGCTCAATCTCGCCTTCGGAAGTGAAAGGAATAAGCTGCTGATCGCGGAAGCAGGAGCCGTTCCAGCTCTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791716.1
MESAMAEALLYGQTEAQIAAARAIGKLDTMQKKRLAESGAISPLIMMLHAQDYESIEASLFALLNLAFGSERNKLLIAEAGAVPALLKILQWRNESLMELSLAALLILSSCSRNKIEIASSGAIQLLVELLNSLSQNVGSNQAKFDIVSTLHNLSTSPQIIPLIVVCGGVIVLIRLVYESEKSSDLVEKAMALLESLVSSSQVALNQVSETGGAIQMVVEAVEEGTAACREHAAGVLLMICKSCRETYRGLILREGAMPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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