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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004760`

染色体: Chr02 坐标: 69792079-69794247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004760`
名称	SmilChr02G004760
描述	carbonic anhydrase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69792079 - 69794247 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008719`
GeneID	`131008719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008719`
原始查询	`LOC131008719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carbonic anhydrase 2-like
产物	carbonic anhydrase 2-like
Arabidopsis	`AT3G01500` (CA1) carbonic anhydrase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821134] identity=66.7; qcov=0.888; evalue=1.91e-137; confidence=high
Rice	`Os01g0639900` (BETACA1) - identity=59.8; qcov=0.604; evalue=2.31e-82; confidence=high
GO	GO:0004089 (carbonate dehydratase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0015976 (carbon utilization)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00484 (Pro_CA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791717.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057791717.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791717.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791717.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69792253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:69792307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:69792565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,D11
`Chr2:69793043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B80,C83,D6
`Chr2:69793097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:69793446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:69793873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B80,C83,D6
`Chr2:69793995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791717.1

327 aa

164

327

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 153-311 aa

XP_057791718.1

321 aa

160

321

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 147-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791717.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	153	311	1.3e-42	146.4	Carbonic anhydrase
`XP_057791718.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	147	305	1.2e-42	146.5	Carbonic anhydrase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935735.1
TGAAAAAAGGAGAAATCCAATCTGCAAGTGTAGAAGCTGTGGTTTACTTATCTTTCGCTTTCGTTATCCTATGGTTTCGCATGCATGCATTGCTTCTAAATCAGTCAGTTAAAGAGAGCACATACCTGTGGCCTATTGAGCAATGTCGACCGTCAACGGCTTCCTCACTCCACCCGCCGCCCGTCTATCACGGCCGGCAGCGGCATGCCGGCCCATCACCGCCACCGCGAAGCTTAGCTCTTCCCCTTCTCCGCCGCCCA...

XM_057935734.1
TATCCTATGGTTTCGCATGCATGCATTGCTTCTAAATCAGTCAGTTAAAGAGAGCACATACCTGTGGCCTATTGAGCAATGTCGACCGTCAACGGCTTCCTCACTCCACCCGCCGCCCGTCTATCACGGCCGGCAGCGGCATGCCGGCCCATCACCGCCACCGCGAAGCTTAGCTCTTCCCCTTCTCCGCCGCCCAGCCTCATCAGAGACGAGCCGTTTTTCGCTGCTCCAGCTCCCATCATCCACCCTGCTCCGAGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008719
ATGTCGACCGTCAACGGCTTCCTCACTCCACCCGCCGCCCGTCTATCACGGCCGGCAGCGGCATGCCGGCCCATCACCGCCACCGCGAAGCTTAGCTCTTCCCCTTCTCCGCCGCCCAGCCTCATCAGAGACGAGCCGTTTTTCGCTGCTCCAGCTCCCATCATCCACCCTGCTCCGAGAGATGATGACTTGGGAAAATATTCATACGAGGAAGCCATAGCTGAACTCGAAAGGCTACTAAGCCATCATTTTTCATATAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791717.1
MSTVNGFLTPPAARLSRPAAACRPITATAKLSSSPSPPPSLIRDEPFFAAPAPIIHPAPRDDDLGKYSYEEAIAELERLLSHHFSYSYKGELAPAAAAKIDQITAELQTDNGSAALSPTVERLKTGFLTFKHKKYNLKPGLYSELARGQTPKYMIFACSDSRVCPSHVLNIQPGEAFVVRNVANMVPAYDKTQYSGAGSAIEYAVLHLKVQEIVVMGHSACGGIKGLMSFPYDGSSSTDFIEDWVKICLPAKAKVTAEHG...

XP_057791718.1
MSTVNGFLTPPAARLSRPAAACRPITATAKLSSSPSPPPSLIRDEPFFAAPAPIIHPAPRDDDLGKYSYEEAIAELERLLSYKGELAPAAAAKIDQITAELQTDNGSAALSPTVERLKTGFLTFKHKKYNLKPGLYSELARGQTPKYMIFACSDSRVCPSHVLNIQPGEAFVVRNVANMVPAYDKTQYSGAGSAIEYAVLHLKVQEIVVMGHSACGGIKGLMSFPYDGSSSTDFIEDWVKICLPAKAKVTAEHGDTAFGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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