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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004707`

染色体: Chr02 坐标: 69353201-69355913 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004707`
名称	SmilChr02G004707
描述	cystinosin homolog
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69353201 - 69355913 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008733`
GeneID	`131008733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008733`
原始查询	`LOC131008733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cystinosin homolog
产物	cystinosin homolog
Arabidopsis	`AT5G40670` (AT5G40670) PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834067] identity=67.3; qcov=0.963; evalue=8.53e-132; confidence=high
Rice	`Os12g0278700` - identity=64; qcov=1.01; evalue=1.32e-126; confidence=high
GO	GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0015184 (L-cystine transmembrane transporter activity); GO:0015811 (L-cystine transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04193 (PQ-loop)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057791749.1`
2	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.40000	`XP_057791749.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057791749.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057791749.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057791749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69353360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:69353365`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A3
`Chr2:69353365`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A3
`Chr2:69353415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C19,D4
`Chr2:69353417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:69353428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:69353814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:69354370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B87
`Chr2:69355182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:69355346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791749.1

273 aa

136

273

PQ-loop

PF04193 PQ-loop 13-69 aa PF04193 PQ-loop 153-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791749.1`	Pfam	`PF04193`	PQ-loop	Repeat	13	69	4e-33	113.7	PQ loop repeat
`XP_057791749.1`	Pfam	`PF04193`	PQ-loop	Repeat	153	209	4e-33	113.7	PQ loop repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935766.1
AAAAACATTGGCAACAAATAACATGGTAAATGTAAGATATCTATCATTTGTTCCATAAGTAGAAGTTGAGATAATCATTTTAGACAGCGCCAAATCATTGTAAAGACACGAGGTTACATCATCATTTTGTTATCCTCATTTTGTTATCTTACGAAAAAAAAAGAAAAACAGAGAGGAACAGTTATTAGATGTTACGTAGGATTAAGGATATATTATGTGTAGAAAACAATTAATATCATACCGGATAAAGAGAATTAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008733
ATGGCGTCTTGGAATTCACTTCACCTCGAGCTTCTCTACAACGTTTTGGGATGGCTCGCTTTCGTCTCTTGGTCCATCAGCTTCTACCCTCAAGTCATCTTGAATTTCCGACGCAAAAGTGTGGTGGGCCTGAATTTTGATTTTGTGCTGCTTAATTTGACGAAGCACTCCTCCTATCTCATCTACAATGCTTCCCTCTTCTTTAGCTCCACCGTGCAGCGCCAGTACCGCGAGAAATTCGGTTCGGATGAGATGATACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791749.1
MASWNSLHLELLYNVLGWLAFVSWSISFYPQVILNFRRKSVVGLNFDFVLLNLTKHSSYLIYNASLFFSSTVQRQYREKFGSDEMIPVAANDVAFSAHAVLLTVFTLSQIVMYDRGSQKISKTAAVIVSVAWLSAAVCVFVAIPRHSWFWLVSCFNTIQVVMTIIKYIPQAVLNFRRKSTVGFSIGNILLDFFGGVTNYFQMVVQSIDQNSWINFYGNIGKTMISLVSVVFDILFMVQHYVLYPASKRASLHPAPVNNEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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