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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004676`

染色体: Chr02 坐标: 69108012-69110559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004676`
名称	SmilChr02G004676
描述	uncharacterized SmilChr02G004676
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69108012 - 69110559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008742`
GeneID	`131008742`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008742`
原始查询	`LOC131008742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0617800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0617800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G71430` (AT1G71430) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843484] identity=48.7; qcov=0.571; evalue=4.09e-26; confidence=medium
Rice	`Os01g0617800` - identity=44.5; qcov=0.646; evalue=3.68e-28; confidence=medium
GO	GO:0000492 (box C/D snoRNP assembly); GO:0062064 (box C/D methylation guide snoRNP complex binding)
KEGG	-
Pfam	PF15370 (NOPCHAP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008742

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791757.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057791757.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791757.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791757.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69108507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85
`Chr2:69108742`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B94
`Chr2:69108742`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B94
`Chr2:69109839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:69109852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C79
`Chr2:69110147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B2,D5
`Chr2:69110189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,C13,C41,C76,D8
`Chr2:69110249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:69110288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:69110294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C73
`Chr2:69110310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791757.1

198 aa

198

NOPCHAP1

PF15370 NOPCHAP1 59-197 aa

XP_057791758.1

198 aa

198

NOPCHAP1

PF15370 NOPCHAP1 59-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791757.1`	Pfam	`PF15370`	NOPCHAP1	Family	59	197	2.1e-16	61.0	NOP protein chaperone 1
`XP_057791758.1`	Pfam	`PF15370`	NOPCHAP1	Family	59	197	2.1e-16	61.0	NOP protein chaperone 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935774.1
ATAATAGAGCCAAATCAGGAAGCGTTAAACTATATGTAAGCGCCGCTCATTTCTTCGCTATTTCTGCCTACCAGACGAGCTTCATCTTCTTCAGCTGGTTCATGCTTGTGAGTGACAATGGCGGAAAACAGAAGCAAAGACCTCTTGGAGCTGGAGGCCAAGCCAGGCGCCGTCTCCTCCGCCTCAAACTTAGAATCAAAACTCTTTGTATGCAAGAAAGATGTCCCTTTTTCTCCTTCTGATGCTTCTCGTCAGAAGCC...

XM_057935775.1
GCCTACCAGACGAGCTTCATCTTCTTCAGCTGGTTCATGCTTGGTATTTCTATTTTCTTTCCTTTCTATTTTTTCAACCCAATCTTTCTATTTATTCAATCCATAGAGAATTTGTGCTTGAATGTAATATTTCAAAGATTGAAAAGGTGTTTGTGTTTTGAACCTGATCAAGAAAATGAGTTTGGTTTTGCACTACTGTTGGAGCAAATTACTTGCTGCATTTTGAATTTTGCTTGAGTGACAATGGCGGAAAACAGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008742
ATGGCGGAAAACAGAAGCAAAGACCTCTTGGAGCTGGAGGCCAAGCCAGGCGCCGTCTCCTCCGCCTCAAACTTAGAATCAAAACTCTTTGTATGCAAGAAAGATGTCCCTTTTTCTCCTTCTGATGCTTCTCGTCAGAAGCCCACCATGGCTCCTCTGCCCAAGAGCCAATTTCTGGGGAAGGTGAAGGACTTCTTAGGAGTTCTATCAGAATCGAATAAAAAACTGATGGAGGATGCAAAGGAACGCCCCGATAGTTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791757.1
MAENRSKDLLELEAKPGAVSSASNLESKLFVCKKDVPFSPSDASRQKPTMAPLPKSQFLGKVKDFLGVLSESNKKLMEDAKERPDSYDIEVISGDESKYIEMDLMLGIADLHTPEAVAAAESAMAGYRPPVRMAESSSRSEDEDSSDDEDDAEEDGNHEQDTEAGSESVKLGLKVGDSLCQESKKQKPKKRPKIVELA

XP_057791758.1
MAENRSKDLLELEAKPGAVSSASNLESKLFVCKKDVPFSPSDASRQKPTMAPLPKSQFLGKVKDFLGVLSESNKKLMEDAKERPDSYDIEVISGDESKYIEMDLMLGIADLHTPEAVAAAESAMAGYRPPVRMAESSSRSEDEDSSDDEDDAEEDGNHEQDTEAGSESVKLGLKVGDSLCQESKKQKPKKRPKIVELA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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