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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004754`

染色体: Chr02 坐标: 69727628-69728425 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004754`
名称	SmilChr02G004754
描述	50S ribosomal protein L12, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69727628 - 69728425 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008747`
GeneID	`131008747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008747`
原始查询	`LOC131008747`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L12, chloroplastic-like
产物	50S ribosomal protein L12%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G27830` (RPL12-A) ribosomal protein L12-A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822403] identity=65.8; qcov=1.03; evalue=2.46e-63; confidence=high
Rice	`Os01g0662300` (rpl12-2) - identity=69; qcov=0.788; evalue=6.74e-45; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00542 (Ribosomal_L12); PF16320 (Ribosomal_L12_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791764.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057791764.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791764.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791764.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69727782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:69727795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:69727821`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B83,C71,C78
`Chr2:69727821`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B83,C71,C78
`Chr2:69727838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr2:69727845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C71,C78
`Chr2:69727946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B73,C22,C3,C51,C55,C63,C74
`Chr2:69727982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B73,C22,C51,C63,C74
`Chr2:69728022`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B15,B61,B72,B84,C3,C43
`Chr2:69728034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr2:69728118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C77
`Chr2:69728119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791764.1

184 aa

184

Ribosomal_L12_N

Ribosomal_L12

PF16320 Ribosomal_L12_N 61-107 aa PF00542 Ribosomal_L12 117-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791764.1`	Pfam	`PF16320`	Ribosomal_L12_N	Domain	61	107	5.8e-16	58.6	Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain
`XP_057791764.1`	Pfam	`PF00542`	Ribosomal_L12	Domain	117	183	9.7e-27	93.8	Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935781.1
TGGAAGTCTGTTAAGTATTGAAGTGGAACAATCCTTATCCTATCTTCTTCTTGCACCTCACTACGCCCTTTCGCTGCTCCATCTCCAAATCTCCACATGGCTTCAACCACGCTATCCTCCGCCACCCTCCGCTCCGCCGCTTATCCTACACTCCCCGCCGCCACCTTCCCCAAGCAGCCGCTCGAATTCCTACCCAAATCCGCCCCCAAACCCCTCCGGCGGCGCGCGCACTTCGTCCGCCCCCTCGCCGCCGTCGACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008747
ATGGCTTCAACCACGCTATCCTCCGCCACCCTCCGCTCCGCCGCTTATCCTACACTCCCCGCCGCCACCTTCCCCAAGCAGCCGCTCGAATTCCTACCCAAATCCGCCCCCAAACCCCTCCGGCGGCGCGCGCACTTCGTCCGCCCCCTCGCCGCCGTCGACGCCCCCGAGAAGGTCATCGAGCTCGGCGACGAGATCTCGAACCTCACCCTCGCCGACGCGCAGAAGCTCGTCGAGTACCTCCAGGACAAGCTCGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791764.1
MASTTLSSATLRSAAYPTLPAATFPKQPLEFLPKSAPKPLRRRAHFVRPLAAVDAPEKVIELGDEISNLTLADAQKLVEYLQDKLGVSAASFAPAAAVAAAPAAGEAPAVVEEKTEFDVVIEDVPSNMRIATIKVVRALTSLALKEAKELIEGLPKKFKEGVSKEEAEEAKKQLEEAGAKVSIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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