当前解析结果
SmilChr02G004724| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004724 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004724 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004724 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69495507 - 69496912 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008748 |
|---|---|
| GeneID | 131008748 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008748 |
| 原始查询 | LOC131008748 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cryptic loci regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822374]; symbol=AT3G27520; hit=AT3G27520; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | cryptic loci regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822374]; symbol=AT3G27520; hit=AT3G27520; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G27520 (AT3G27520)cryptic loci regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822374] identity=42.8; qcov=1.06; evalue=2.86e-40; confidence=medium |
| Rice | Os02g0595300 (OJ1126_D09.25)- identity=34.7; qcov=0.962; evalue=1.49e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008748 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791765.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057791765.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057791765.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057791765.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791765.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69495881 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B11,C19,D4 |
Chr2:69496013 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B104,B11,C19,D4 |
Chr2:69496047 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B122,B93,C2 |
Chr2:69496070 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr2:69496294 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B36,B47,C56,C65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。