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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004812`

染色体: Chr02 坐标: 70282001-70284079 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004812`
名称	SmilChr02G004812
描述	putative B3 domain-containing protein Os04g0347400
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70282001 - 70284079 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008803`
GeneID	`131008803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008803`
原始查询	`LOC131008803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative B3 domain-containing protein Os04g0347400
产物	putative B3 domain-containing protein Os04g0347400
Arabidopsis	`AT2G24680` (AT2G24680) transcriptional factor B3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817004] identity=25.8; qcov=0.712; evalue=5.93e-09; confidence=low
Rice	`Os03g0622100` - identity=28.2; qcov=0.396; evalue=6.78e-08; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791833.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791833.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791833.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791833.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70282078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B26,C38,C51
`Chr2:70282081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B60,B79,C4,C75,D1
`Chr2:70282095`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A13,B119,B120,B127,B128,B21,B22,B53,B61,B71,C39,C46,C54,C55,C74,C86
`Chr2:70282109`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A15,B103,B54,C16,C57
`Chr2:70282109`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A15,B103,B54,C16,C57
`Chr2:70282477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C15
`Chr2:70282488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:70282561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B103,B54,C16,C57
`Chr2:70282634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:70283592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:70283624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:70283690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791833.1

279 aa

140

279

PF02362 B3 37-121 aa PF02362 B3 168-255 aa

XP_057791834.1

278 aa

139

278

PF02362 B3 37-121 aa PF02362 B3 166-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791833.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	37	121	2e-26	92.6	B3 DNA binding domain
`XP_057791833.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	168	255	2e-26	92.6	B3 DNA binding domain
`XP_057791834.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	37	121	8.1e-28	97.0	B3 DNA binding domain
`XP_057791834.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	166	254	8.1e-28	97.0	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935850.1
ATTCAAGTATTATTTAATATATATATCGATGTATAAAGTGGCTACTACATATGTACTACACATTCGGCCAGTACCCACATGCAAAACCCATTTTCAATCATTTTAGCTCAGTCGAAATGGCAAAAGATGAGGTTGCGGCTACAAGCAAAATTGTGTTGTCTGCAGGTTTCAAGAAAAAAATGATGCTGCCATCAGTGTATTATAAGAAGATAAAACAAGAGAAATCAGAATGGGCAATCTTGAAAACCCCTAAAGGAAAG...

XM_057935851.1
ATTCAAGTATTATTTAATATATATATCGATGTATAAAGTGGCTACTACATATGTACTACACATTCGGCCAGTACCCACATGCAAAACCCATTTTCAATCATTTTAGCTCAGTCGAAATGGCAAAAGATGAGGTTGCGGCTACAAGCAAAATTGTGTTGTCTGCAGGTTTCAAGAAAAAAATGATGCTGCCATCAGTGTATTATAAGAAGATAAAACAAGAGAAATCAGAATGGGCAATCTTGAAAACCCCTAAAGGAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008803
ATGTACTACACATTCGGCCAGTACCCACATGCAAAACCCATTTTCAATCATTTTAGCTCAGTCGAAATGGCAAAAGATGAGGTTGCGGCTACAAGCAAAATTGTGTTGTCTGCAGGTTTCAAGAAAAAAATGATGCTGCCATCAGTGTATTATAAGAAGATAAAACAAGAGAAATCAGAATGGGCAATCTTGAAAACCCCTAAAGGAAAGTGGAGAGTGAAAGTGTGTAGAGATGATGATGGTGACATCTTCTTCAAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791833.1
MYYTFGQYPHAKPIFNHFSSVEMAKDEVAATSKIVLSAGFKKKMMLPSVYYKKIKQEKSEWAILKTPKGKWRVKVCRDDDGDIFFKNGWSEFADENAFNNHDSLVLEHTCNLMCFNVNVNVADVAAVSTPPQNRGSSQAKSCKGKEKKKDVVSPHTHTHSQWPQFFRKRMTDYCGTKGAMVHIPLELARSNNLTSKESVSLMDPGGKEWAFKLQIQNDLLTGKLRRLLISGWHKFYVANHLKSGDVCEFTLNPASSSTST...

XP_057791834.1
MYYTFGQYPHAKPIFNHFSSVEMAKDEVAATSKIVLSAGFKKKMMLPSVYYKKIKQEKSEWAILKTPKGKWRVKVCRDDDGDIFFKNGWSEFADENAFNNHDSLVLEHTCNLMCFNVNVNVADVAAVSTPPQNRGSSQAKSCKGKEKKKDVVSPHTHTHSQWPQFFRKRMTDYCGTKGAMHIPLELARSNNLTSKESVSLMDPGGKEWAFKLQIQNDLLTGKLRRLLISGWHKFYVANHLKSGDVCEFTLNPASSSTSTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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