当前解析结果
SmilChr01G002751| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002751 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002751 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002751 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 45827404 - 45829092 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008808 |
|---|---|
| GeneID | 131008808 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008808 |
| 原始查询 | LOC131008808 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008808 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057791847.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057791847.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791847.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791847.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791847.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:45827505 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B40,B49 |
Chr1:45827505 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B40,B49 |
Chr1:45827534 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr1:45827537 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr1:45827549 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B35,B36,B88,D6,D7 |
Chr1:45827577 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr1:45827593 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr1:45827601 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 34 | A16,A18,A19,A2,A4,B107,B120,B121,B128,B136,B16,B17,B22,B30,B52,B56,B60,B62,B71,B79,C10,C14,C18,C21,C30,C35,C40,C41,C5,C52,C6,C63,C72,C75 |
Chr1:45827613 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,B59 |
Chr1:45827628 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr1:45827794 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B28,B40,B48,C78,D3 |
Chr1:45827807 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B64,C16 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。