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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004817`

染色体: Chr02 坐标: 70310331-70311582 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004817`
名称	SmilChr02G004817
描述	B3 domain-containing protein REM16-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70310331 - 70311582 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008810`
GeneID	`131008810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008810`
原始查询	`LOC131008810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein REM16-like
产物	B3 domain-containing protein REM16-like
Arabidopsis	`AT4G33280` (AT4G33280) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829464] identity=30.6; qcov=0.521; evalue=2.16e-14; confidence=low
Rice	`Os01g0723500` - identity=35.2; qcov=0.454; evalue=1.92e-15; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791846.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791846.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791846.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791846.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70310702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:70310765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:70310798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B84,C38
`Chr2:70310872`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A25,B133,C18,C34,C47,C48
`Chr2:70310881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B69
`Chr2:70310989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B69
`Chr2:70311000`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B87
`Chr2:70311000`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B87
`Chr2:70311007`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr2:70311007`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr2:70311052`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr2:70311052`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791846.1

238 aa

119

238

PF02362 B3 17-94 aa PF02362 B3 152-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791846.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	17	94	8.7e-27	93.7	B3 DNA binding domain
`XP_057791846.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	152	227	8.7e-27	93.7	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935863.1
TTGTTTGTGGAACTCATTAATTGCTTCCATTATCATGATAACAATGCCCCCTCCCTCTCTCCTTCTGCAACTCTAGATTTCAACTATTCTCAAATGGCATTTGGAACCAAATTTGTGAACATAATGATGCCCGATCTCATGGAAAGAATGAAGGTGCCATCAGCCTACTGTGAGAAGCTACAACAAGAGAAATCAAGAAAGGCAGTGTTGAAAACTCCTAAAGGAAGTTGGGAAATGAAGGTGCGCAGAGACGATGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008810
ATGGCATTTGGAACCAAATTTGTGAACATAATGATGCCCGATCTCATGGAAAGAATGAAGGTGCCATCAGCCTACTGTGAGAAGCTACAACAAGAGAAATCAAGAAAGGCAGTGTTGAAAACTCCTAAAGGAAGTTGGGAAATGAAGGTGCGCAGAGACGATGATGGTGACATCGTCTTCGAAGACGGATGGCCACGATTTGCCCGCGACCACGCCCTGAACGACCGCGATTTTCTAGCGTTCGAGCACACGGGCAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791846.1
MAFGTKFVNIMMPDLMERMKVPSAYCEKLQQEKSRKAVLKTPKGSWEMKVRRDDDGDIVFEDGWPRFARDHALNDRDFLAFEHTGNLHFDVVVCDARTACEKKPIADCRNAMPQNQDKGKAEKKGVIESQIMPSFSIDITPYIVPTKFKSPVVGIPAQFARRSNLDSKKSISLRDPKNRKWPINLIVKREPYFRVSMCGGWRDFYAANAKHLKIGDKCILHLNSTSSTSKTAALDVEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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