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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004818`

染色体: Chr02 坐标: 70312072-70313702 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004818`
名称	SmilChr02G004818
描述	60S ribosomal protein L44
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70312072 - 70313702 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008811`
GeneID	`131008811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008811`
原始查询	`LOC131008811`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L44
产物	60S ribosomal protein L44
Arabidopsis	`AT3G23390` (AT3G23390) Zinc-binding ribosomal protein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821920] identity=94.3; qcov=1; evalue=4.86e-68; confidence=high
Rice	`Os07g0523100` (OJ1047_A06.130) - identity=94.3; qcov=1; evalue=2.14e-68; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00935 (Ribosomal_L44)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791848.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791848.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791848.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791848.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791848.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70312393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B14,B41,C26,C76
`Chr2:70312672`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A11,B103,B121,B136,B4,C17,C54,C58
`Chr2:70312741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B105,B65,B87,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791848.1

105 aa

105

Ribosomal_L44

PF00935 Ribosomal_L44 19-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791848.1`	Pfam	`PF00935`	Ribosomal_L44	Family	19	94	1.7e-33	115.6	Ribosomal protein L44

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935865.1
ATTTCTAACCCATTAGAAAATTGCAAGTCAAGAAAAGAGAGAGAAAATTATACTTGGTTTACAAGAAGAGGCAATGTCCAATTTGAGAATTTGGGCCGGCCCATCATAAGCCCCATTTTATATAACTCTAAACCCTAATTGAGACGAGTTCTGCTGCAAATCGCAATTTTACAGAGACCTTCCTAGCCGTAAGCCATGGTGAACGTTCCAAAGACAAAAAAGACTTACTGCAAATCAAAGGAGTGCAAAAAGCACACCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008811
ATGGTGAACGTTCCAAAGACAAAAAAGACTTACTGCAAATCAAAGGAGTGCAAAAAGCACACCTTGCATAAGGTGACCCAGTACAAGAAGGGGAAGGATAGTTTAGCTGCTCAAGGAAAGAGACGTTATGATCGCAAGCAGTCAGGTTATGGTGGTCAGACCAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCCAAAACAACCAAGAAGATTGTGTTGAGGCTGCAATGCCAGGGCTGCAAGCATGTCTCCCAACACCCAATCAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791848.1
MVNVPKTKKTYCKSKECKKHTLHKVTQYKKGKDSLAAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPVFHKKAKTTKKIVLRLQCQGCKHVSQHPIKRCKHFEIGGDKKGKGTSLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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