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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000296`

染色体: Chr01 坐标: 5830855-5833154 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000296`
名称	SmilChr01G000296
描述	uncharacterized SmilChr01G000296
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5830855 - 5833154 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008818`
GeneID	`131008818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008818`
原始查询	`LOC131008818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G13320` (AT4G13320) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826962] identity=50; qcov=0.071; evalue=1.04e-09; confidence=weak
Rice	`Os12g0142900` - identity=44.4; qcov=0.247; evalue=5.51e-44; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791898.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791898.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791898.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057791898.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057791898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5830863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:5830872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:5830895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C26
`Chr1:5830992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:5830993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:5830996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:5831004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C54
`Chr1:5831006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,D8
`Chr1:5831044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:5831166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:5831314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B106,B99,C41
`Chr1:5831623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791898.1

729 aa

364

729

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

RVT_1

PF19259 Ty3_capsid 101-282 aa PF03732 PEG10_N-capsid 105-185 aa PF00078 RVT_1 621-717 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791898.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	101	282	5.7e-09	36.4	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057791898.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	105	185	5e-15	56.3	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057791898.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	621	717	1.6e-19	71.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935915.1
ATGGTTAACGACAAAGACAAGGTACCTGAGCCTACCATCGCTGATGTGCTCAGAGAGGTGCAACGTCTGACAATAGCAGTTGATATGTTAACTACTCGTGTTGAGCGAGTAGAGGAACGTCGGGGTAATCCAGGAGACGGAGAAGGAGGCAGGAGATTTGCTCGTGTCCTTCAACGTACGGGTCCCCAACCGATTGGTGTGAAACAAACTTATGAGGAGGATTCATCTGATGAAGAAGCGAAAGAGTTGTTTGCAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008818
ATGGTTAACGACAAAGACAAGGTACCTGAGCCTACCATCGCTGATGTGCTCAGAGAGGTGCAACGTCTGACAATAGCAGTTGATATGTTAACTACTCGTGTTGAGCGAGTAGAGGAACGTCGGGGTAATCCAGGAGACGGAGAAGGAGGCAGGAGATTTGCTCGTGTCCTTCAACGTACGGGTCCCCAACCGATTGGTGTGAAACAAACTTATGAGGAGGATTCATCTGATGAAGAAGCGAAAGAGTTGTTTGCAGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791898.1
MVNDKDKVPEPTIADVLREVQRLTIAVDMLTTRVERVEERRGNPGDGEGGRRFARVLQRTGPQPIGVKQTYEEDSSDEEAKELFAENPNPNPRGNQRHDEFRMKADLPSFNGNFNIEAFLDWIAEVERFFDFAEIHENKQVKLVAYRLKGGASPWWEQVQNQRRRLGKQPVRLWVKMKRMMMARFLPPDHEQFLFHQYQTLIQGQKSVADYTTDFLRLSSRNNLMETEGQQISRYIHGLKPTIREKIGCQVILTLSEAQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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