当前解析结果
SmilChr01G002759| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002759 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002759 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002759 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 45924199 - 45931106 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008826 |
|---|---|
| GeneID | 131008826 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008826 |
| 原始查询 | LOC131008826 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008826 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791872.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791872.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791872.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791872.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791872.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:45924323 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C17 |
Chr1:45924342 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,D11 |
Chr1:45924349 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr1:45924358 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C40,D8 |
Chr1:45924368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr1:45924393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr1:45924609 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr1:45924651 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B17,B27,C76,D11 |
Chr1:45924668 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B17,B27,C76,D11 |
Chr1:45924711 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B44,B50,B8,C3 |
Chr1:45924717 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr1:45924735 |
CAG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。