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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004838`

染色体: Chr02 坐标: 70495683-70497040 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004838`
名称	SmilChr02G004838
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70495683 - 70497040 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008834`
GeneID	`131008834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008834`
原始查询	`LOC131008834`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=39; qcov=1.02; evalue=1.47e-94; confidence=medium
Rice	`Os08g0543400` - identity=26.6; qcov=0.847; evalue=8.84e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791884.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791884.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791884.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791884.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791884.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70495783`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr2:70495783`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr2:70495884`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A15,A22,B103,B106,B110,B119,B120,B135,B138,B54,B58,B65,B77,C16,C24,C29,C50,C51
`Chr2:70495893`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C42
`Chr2:70495893`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C42
`Chr2:70495896`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C42
`Chr2:70495896`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C42
`Chr2:70495903`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B109,B114,C34
`Chr2:70495903`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B109,B114,C34
`Chr2:70495921`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,A19,A21,B112,B5,B7,B75,C42,C44,C63
`Chr2:70496060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,A6,C5,C81
`Chr2:70496120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B4,B48,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791884.1

417 aa

208

417

Transferase

PF02458 Transferase 5-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791884.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	5	409	1e-69	236.0	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935901.1
AAGCATTGATTAAAAAAAGAAAAAACCCGAAATAGAAAGATGGAGCAGATAATCACGGCGAGTCGTAGTGTGAAGCCATCATCTCCAACTCCGCTTGCATCCAAAACCCACAAACTATCATTTCTCGACCAAGTTGCACCACCAGTTTACCTCACCCTCATCTTCTTCTACGAAAATGCTCAATCTCAGCAGCACGATGAAATCTCGCGACGTCTCAAACAATCTCTGTCGGAGATCCTTACCATCTTCTATCCCTTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008834
ATGGAGCAGATAATCACGGCGAGTCGTAGTGTGAAGCCATCATCTCCAACTCCGCTTGCATCCAAAACCCACAAACTATCATTTCTCGACCAAGTTGCACCACCAGTTTACCTCACCCTCATCTTCTTCTACGAAAATGCTCAATCTCAGCAGCACGATGAAATCTCGCGACGTCTCAAACAATCTCTGTCGGAGATCCTTACCATCTTCTATCCCTTGGCAGGCACAATCAAGCAAAACACATTCGTCGACTGCAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791884.1
MEQIITASRSVKPSSPTPLASKTHKLSFLDQVAPPVYLTLIFFYENAQSQQHDEISRRLKQSLSEILTIFYPLAGTIKQNTFVDCNDSGANFAESRVHARLAHFTQNPKMEQLGKLIPAGFSSAADNPTLSVKTSYFDCGGVAVAVFFPHTIGDTSCFATFMNAWAAASRGEASRIIHPSFDLALRFPPRDIFVSGFRAGVTEEKIATRRLVFDKEKVESIRELEASRSEVKDPSRVEAVSAFLWRSFIRAHKQTGRGET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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