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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004870`

染色体: Chr02 坐标: 70792979-70793942 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004870`
名称	SmilChr02G004870
描述	40S ribosomal protein S27-2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70792979 - 70793942 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008867`
GeneID	`131008867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008867`
原始查询	`LOC131008867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S27-2-like
产物	40S ribosomal protein S27-2-like
Arabidopsis	`AT3G61110` (RS27A) ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825283] identity=94.2; qcov=0.775; evalue=9.25e-59; confidence=high
Rice	`Os02g0478700` - identity=93; qcov=0.775; evalue=1.19e-48; confidence=medium
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01667 (Ribosomal_S27e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057791947.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791947.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791947.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791947.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70793273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:70793284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:70793297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:70793347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B98,C48
`Chr2:70793363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:70793376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B71,B72,C20,C73
`Chr2:70793541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C72
`Chr2:70793663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:70793691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:70793705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D6
`Chr2:70793723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:70793725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791947.1

111 aa

111

Ribosomal_S27e

PF01667 Ribosomal_S27e 55-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791947.1`	Pfam	`PF01667`	Ribosomal_S27e	Family	55	109	5.9e-27	93.9	Ribosomal protein S27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935964.1
ATGTTTAAAACCCTAGGTTTGCTTACGCTGCGTGGAGCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGCCAAGATGGTTCTCTCCAATGATTACGATTTGCTCAACCCACCGGCCGAGCTTGAGAAGAGGAAGCACAAGCTCAAGCGCCTCGTGCAATCCCCCAACTCCTTCTTCATGGATGTCAAGTGTCAGGGTTGCTTTAACATAACAACTGTTTTCAGCCACTCCCAAACCGTTGTTGTGTGTGGAAACTGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008867
ATGTTTAAAACCCTAGGTTTGCTTACGCTGCGTGGAGCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGCCAAGATGGTTCTCTCCAATGATTACGATTTGCTCAACCCACCGGCCGAGCTTGAGAAGAGGAAGCACAAGCTCAAGCGCCTCGTGCAATCCCCCAACTCCTTCTTCATGGATGTCAAGTGTCAGGGTTGCTTTAACATAACAACTGTTTTCAGCCACTCCCAAACCGTTGTTGTGTGTGGAAACTGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791947.1
MFKTLGLLTLRGALSSLSLSLSTAKMVLSNDYDLLNPPAELEKRKHKLKRLVQSPNSFFMDVKCQGCFNITTVFSHSQTVVVCGNCQTVLCQPTGGRARLTEGCSFRRKGD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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