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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004873`

染色体: Chr02 坐标: 70807608-70815819 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004873`
名称	SmilChr02G004873
描述	DDT domain-containing protein DDR4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70807608 - 70815819 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008869`
GeneID	`131008869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008869`
原始查询	`LOC131008869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DDT domain-containing protein DDR4
产物	DDT domain-containing protein DDR4
Arabidopsis	`AT1G18950` (AT1G18950) DDT domain superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838476] identity=56.1; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0193600` - identity=56; qcov=0.765; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0031213 (RSF complex)
KEGG	-
Pfam	PF02791 (DDT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791949.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057791949.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057791949.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057791949.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70807951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B57,B63,C16
`Chr2:70807978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C16,C51
`Chr2:70807993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:70808040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:70808056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C74
`Chr2:70808350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B48,C20,C33
`Chr2:70808413`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr2:70808413`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B70
`Chr2:70808418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:70808673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:70809151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr2:70810024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791949.1

793 aa

396

793

DDT

PF02791 DDT 188-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791949.1`	Pfam	`PF02791`	DDT	Family	188	233	2.7e-06	28.1	DDT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935966.1
CCTAATAGTAGAATTTAATTCCCAATGGAATCCACCACAAAAGGGTCTCTCCCTCCCTCGCCAGAAACCCTCAAACCTAATAGTGGAATTTAATTCCCAATAATTCCTTTGCTCTCCTCTCAGATTTTTAATCAAATTTCACCTTTTCCACGCCAAAAATTACCCTCTTTCTTCAAAATCCTCATATTTTACCAGCTATATTTATTTTTACAAAATCCAATTCCCCTCAAATTTCTGTCTGCTTGTCCCTCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008869
ATGCAAGCCCTTGATCTCCCATGTAACCCTTCCCTTGACCGTCGCCGGCCCGATCCCTCCGCCATGCCGGAGCATTACTCGCCGATCCACTCTCCGGACCATCACTCGCCGGAAAATTCGGAACACAGAAAGTCCGGTGTCGAAAATAATACCAAGGGCGAGAGTATTAAGGAGAATAATTTGAAGTCTGCTAGTGATAATAATGGTAATAGTAGTGTAGTAGGTAGGAGGGAGAGGCCGTCGAGGGCATGCACGCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791949.1
MQALDLPCNPSLDRRRPDPSAMPEHYSPIHSPDHHSPENSEHRKSGVENNTKGESIKENNLKSASDNNGNSSVVGRRERPSRACTQRAAARLQAAAEAEAAMAEAERKRKKKRRERLTARLLKEESEEEDGYRDDDEEGGENEENGEEDGSTSLAQLQSSRIITPLLGEPEASQLPRWNIRSMWQLASILNFLNVFRPLLNVKVEFSADEFETALIIPNNTLAEIHMPLLKAIPPVTRMALNHATWITVLCRKLRDWWHW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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