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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004875`

染色体: Chr02 坐标: 70834368-70838535 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004875`
名称	SmilChr02G004875
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70834368 - 70838535 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008872`
GeneID	`131008872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008872`
原始查询	`LOC131008872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
Arabidopsis	`AT1G74780` (AT1G74780) Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843817] identity=59.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0639100` (OsMFS8) - identity=53; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF07690 (MFS_1); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057791952.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057791952.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791952.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791952.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70834598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:70834668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr2:70834676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,C16,C24,C51
`Chr2:70834726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B20,B68,C61
`Chr2:70834833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B114
`Chr2:70837251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B35,B98
`Chr2:70837410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr2:70837435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:70837490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:70837611`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,A3,A6,B11,B136,B20,B24,B4,B57,B63,B68,B94,B98,C1,C12,C35,C4,C41,C57,C61,D10,D11,D4
`Chr2:70837613`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,A3,A6,B11,B136,B20,B24,B4,B57,B63,B68,B94,B98,C1,C12,C35,C4,C41,C57,C61,D10,D11,D4
`Chr2:70837650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B20,C36,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791952.1

527 aa

264

527

Nodulin-like

NFD4_C

MFS_1

PF06813 Nodulin-like 5-261 aa PF23262 NFD4_C 315-516 aa PF07690 MFS_1 321-514 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791952.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	5	261	2.7e-65	221.1	Nodulin-like
`XP_057791952.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	315	516	5e-23	82.8	NFD4, C-terminal domain
`XP_057791952.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	321	514	2.8e-12	47.0	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935969.1
TAGTTGTGATTGTGAATTTCGACACAATTCATACACGATAAACACACCTCAGTGAGACCACAATTAAACGGGAACGGAAGTAACAATAGAATAGGCTGAATAGCTATGGAGGCCAGCAAATGGACCGCCGCGGCGGCGAGCATTTGGATCCAGTGCAGCTGCGGCGCGTCTTACGCCTTCGGCATCTACTCGCCGATCCTCAAATCGAGCCAAGGCTACGACCAATCGACGCTCGACACCATCTCCGTCTTCAAGGACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008872
ATGGAGGCCAGCAAATGGACCGCCGCGGCGGCGAGCATTTGGATCCAGTGCAGCTGCGGCGCGTCTTACGCCTTCGGCATCTACTCGCCGATCCTCAAATCGAGCCAAGGCTACGACCAATCGACGCTCGACACCATCTCCGTCTTCAAGGACATCGGCGCCAACGCCGGTATCCTCTCCGGCATCCTCTACTCCGCCGCCTGCCGCAGCGGCGCGACGCCGAGATTTCTGCGCGGACCGTGGATCGTCCATGCGGCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791952.1
MEASKWTAAAASIWIQCSCGASYAFGIYSPILKSSQGYDQSTLDTISVFKDIGANAGILSGILYSAACRSGATPRFLRGPWIVHAAGAAQCLVGYLFLWLAVTGAIPRPHVAVVCLFMFLGAHAQTFFNTANVVTAVQNFPAYNGTVVGIMKGFLGLSGAVLIQVYQTLFEGKPATFLLMLAVVPSLLSVALMFLVRVHPTGSRDHEKTYLNAFSLISMIVAAYVMFLIIVENAFVLSPWTRALSLTLLFLILSSPLHIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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