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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004883`

染色体: Chr02 坐标: 70921752-70925604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004883`
名称	SmilChr02G004883
描述	uncharacterized SmilChr02G004883
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70921752 - 70925604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008881`
GeneID	`131008881`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008881`
原始查询	`LOC131008881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Integral membrane HPP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836393]; symbol=AT5G62720; hit=AT5G62720; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Integral membrane HPP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836393]; symbol=AT5G62720; hit=AT5G62720; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G62720` (AT5G62720) Integral membrane HPP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836393] identity=62; qcov=0.922; evalue=1.01e-89; confidence=high
Rice	`Os03g0684700` - identity=75.3; qcov=0.649; evalue=9.85e-79; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04982 (TM_HPP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008881

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791965.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057791965.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057791965.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791965.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791965.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70921879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C47
`Chr2:70921903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,C20,D6
`Chr2:70922114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:70922291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr2:70922360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:70924861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C14,C72,C85
`Chr2:70924927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C4
`Chr2:70925125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B64,C8
`Chr2:70925184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C14,C72
`Chr2:70925234`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A2,B48,B64,B94,C20,C8,D6
`Chr2:70925235`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B46,C14,C72
`Chr2:70925235`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B46,C14,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791965.1

241 aa

120

241

TM_HPP

PF04982 TM_HPP 77-223 aa

XP_057791966.1

231 aa

116

231

TM_HPP

PF04982 TM_HPP 77-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791965.1`	Pfam	`PF04982`	TM_HPP	Domain	77	223	3e-31	108.9	HPP, transmembrane region
`XP_057791966.1`	Pfam	`PF04982`	TM_HPP	Domain	77	225	4.6e-32	111.5	HPP, transmembrane region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935983.1
CCCTTGGACATCTCCAAGAGGCCTCTCTCGCTCACCTGCCTCCACAAACGGTCTCTCTCTTAAAATCTCACAGTTATTTATTTGGGAATTTCAAATAATAAAATCTCCTGAATCAAAATTAACCAATGATGTGTGCGCAGGTTCACGCCTGCGCCTTTAATCAGGTTTTATCGCCGCAAACTCAGCTGCCGTTAATTTCCTTCCGCAATTCAATTGCTGCAAAATGTGATTTGGACAAGGACAAAAGGGTTATTGGATCC...

XM_057935982.1
TTGGACATCTCCAAGAGGCCTCTCTCGCTCACCTGCCTCCACAAACGGTCTCTCTCTTAAAATCTCACAGTTATTTATTTGGGAATTTCAAATAATAAAATCTCCTGAATCAAAATTAACCAATGATGTGTGCGCAGGTTCACGCCTGCGCCTTTAATCAGGTTTTATCGCCGCAAACTCAGCTGCCGTTAATTTCCTTCCGCAATTCAATTGCTGCAAAATGTGATTTGGACAAGGACAAAAGGGTTATTGGATCCAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008881
ATGATGTGTGCGCAGGTTCACGCCTGCGCCTTTAATCAGGTTTTATCGCCGCAAACTCAGCTGCCGTTAATTTCCTTCCGCAATTCAATTGCTGCAAAATGTGATTTGGACAAGGACAAAAGGGTTATTGGATCCAAAAATTCGAGAAGAAAGGGGTTTCGCATTGCTTCATCGAGTAATGTGAGTGCTCCATTATGGGAGAATTGGGCTCCCGAGAAGAGCTCCAAAGCTCCCTCCCTCAGCGACATTCTTTGGCCTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791965.1
MMCAQVHACAFNQVLSPQTQLPLISFRNSIAAKCDLDKDKRVIGSKNSRRKGFRIASSSNVSAPLWENWAPEKSSKAPSLSDILWPSAGAFAAMALLGKIDQIVAPKGVSMTIAPLGAVCAVLFATPASPGARKYNMFVAQIGCAAIGVLAFSVLGPGWLARSTALAAAMAFMIITRSVHPPAASLPLLFIDGVKLHHLNFWYALFPGAAGCILLCLIVSLCDSLFLFFCSAYSLLMRRLR

XP_057791966.1
MMCAQVHACAFNQVLSPQTQLPLISFRNSIAAKCDLDKDKRVIGSKNSRRKGFRIASSSNVSAPLWENWAPEKSSKAPSLSDILWPSAGAFAAMALLGKIDQIVAPKGVSMTIAPLGAVCAVLFATPASPGARKYNMFVAQIGCAAIGVLAFSVLGPGWLARSTALAAAMAFMIITRSVHPPAASLPLLFIDGVKLHHLNFWYALFPGAAGCILLCLIQEMVCYLKSNLKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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