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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004935`

染色体: Chr02 坐标: 71328852-71334996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004935`
名称	SmilChr02G004935
描述	phospholipase D gamma 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71328852 - 71334996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008906`
GeneID	`131008906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008906`
原始查询	`LOC131008906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase D gamma 1-like
产物	phospholipase D gamma 1-like
Arabidopsis	`AT2G42010` (PLDBETA1) phospholipase D beta 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818802] identity=67.7; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0524400` (OsPLDbeta1) - identity=70.9; qcov=0.735; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004630 (D-type glycerophospholipase activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009395 (phospholipid catabolic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2); PF00614 (PLDc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791997.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791997.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791997.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057791997.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057791997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71329300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:71329314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:71329566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:71329587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:71330144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:71330198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:71330231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr2:71330454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:71330868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:71331359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:71332540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:71332565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,C25,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791997.1

1117 aa

558

1117

PLDc

PF00168 C2 306-431 aa PF00614 PLDc 523-1106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791997.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	306	431	8.4e-16	58.8	C2 domain
`XP_057791997.1`	Pfam	`PF00614`	PLDc	Domain	523	1106	3.6e-226	752.6	Phospholipase D

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936014.1
ATTTCATGGCTGATCAAGCAACAACCTTCTAGAACTCAATAGACAAAATAAAATCATTCGAGAAAGATTTGACTTCGTTTTGGCAGTGGATTTCGTATTTCATACGATGAAACTTCTTTCATAACTGGAAAAACCGACACAAAAATACAGGGAAAAACTACAAAGGGAAACAACGTGTTTCTGTTTGTGCATAAGCCAATCAGATAATTCCACGTGTTTCTGAAACCCATTACCTATGTAACTCCGAATCATCAAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008906
ATGGAGAACCAGAACAATTACCCTGCACCTCCATACCCTTACAATCCGGCCTACGGCTACGCCGGTGGGCCAGTGCCGCCAAACCAATACCCTCCACCTAGCCCGTATCCGCCTCCTAATCCCGGTGGACAGCCTGCTTATCCTCCTCTGCCTGCCGGCCCATACGCGGCCTATCCGGCATATCCTTATTATCAGAGCCCCTATGCCCCTCCGCCTCTGAGTTATCCATACCAAAGTGCCCCAACGTCATCATTGCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791997.1
MENQNNYPAPPYPYNPAYGYAGGPVPPNQYPPPSPYPPPNPGGQPAYPPLPAGPYAAYPAYPYYQSPYAPPPLSYPYQSAPTSSLPPPAPHHAPDYSSHAYPYHGYPAPSSSPPPSSSAPTQPNFETYGSFRYGSFHYLHHQASGRLQPPDAHPETPPRAPSDHSSHHHHHHQGSLLPPVGDSAHSVHSDECSSSHPPLYPPIDDHLANMHLSEIQTRPSSVPASPPAPAAAVVGPQKFHSGPLPMTTTTGSGGKHGHHH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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