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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005054`

染色体: Chr02 坐标: 72251594-72258458 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005054`
名称	SmilChr02G005054
描述	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72251594 - 72258458 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008914`
GeneID	`131008914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008914`
原始查询	`LOC131008914`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5
产物	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5
Arabidopsis	`AT1G55020` (LOX1) lipoxygenase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841944] identity=66; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0700700` (OsLOX1) - identity=59.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016702 (oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen); GO:0034440 (lipid oxidation); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil00591 (Linoleic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00305 (Lipoxygenase); PF01477 (PLAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792013.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057792013.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057792013.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792013.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72251969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B94,C44
`Chr2:72252132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:72255002`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B98
`Chr2:72255002`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B98
`Chr2:72255139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:72255198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:72255404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:72255593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:72255595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:72256009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C51
`Chr2:72256009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:72256077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B70,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792013.1

864 aa

432

864

PLAT

Lipoxygenase

PF01477 PLAT 62-162 aa PF00305 Lipoxygenase 176-847 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792013.1`	Pfam	`PF01477`	PLAT	Domain	62	162	2.6e-20	74.0	PLAT/LH2 domain
`XP_057792013.1`	Pfam	`PF00305`	Lipoxygenase	Domain	176	847	0	1036.2	Lipoxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936030.1
ATAGATGAGATCGGTCTCACCCAAGTTTTTGCGTTGATATATTCGTGTGGTAAAGAGAAGAATATAATCACATTAAAGAAAAGTAGCCCATAAGCAATTGTAGAGAATGAAAGCTGCATAAAGTTGAAGGAAGACTCCTCTCAAAAAAAAAAAGTTGAAGGAAGACCAGTAGCTACATATGGAAAAAAAACTAGAGAGTTACTATTAACTACATTTGATAATGATGAGTGTATGAGCTAGAAATTGAAAACGTGGTCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008914
ATGTTGAAAGGCATAGTAGACACGCTGTCGGGGAAAAATGGGGAAGAGAAGAAGAAGATAAAAGGAAGAGTGGTGTTGATGAAGAAGAATGTTCTAGACTTCAACGATTTAGGGGCATCCATTCTCGATCGTCTCCACGAGCTCGTCGGTCAAAGCGTTACTCTGCATCTCATCAGTTCCGACCATTCTGACTCCGCAGGAAATGCGGTGAAGGGGAAGGTGGGAAAAGGAGCAGAGCTAGAGAGCTGGATCACAACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792013.1
MLKGIVDTLSGKNGEEKKKIKGRVVLMKKNVLDFNDLGASILDRLHELVGQSVTLHLISSDHSDSAGNAVKGKVGKGAELESWITTITSLKPEDSAYDVTFDWEEDIGIPGAFLIKNSHHSEFYLKTLTLDGVPGHEHAPIHFVCNSWVYPSDKYKSDRVFFANQAYLPSQTPAPLVPYREEELLHLRGDGSGELQEWDRVYDYAYYNDLGDPDSGEDSARPVLGGSSDYPYPRRGRTGRPPTKTDPNTESRIPILMSLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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