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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004944`

染色体: Chr02 坐标: 71396097-71400579 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004944`
名称	SmilChr02G004944
描述	UTP:RNA uridylyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71396097 - 71400579 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008922`
GeneID	`131008922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008922`
原始查询	`LOC131008922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UTP:RNA uridylyltransferase 1
产物	UTP:RNA uridylyltransferase 1
Arabidopsis	`AT2G45620` (AT2G45620) Nucleotidyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819170] identity=50.3; qcov=1.1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0188300` (OsNTP10) - identity=66.7; qcov=0.505; evalue=1.75e-177; confidence=medium
GO	GO:0050265 (RNA uridylyltransferase activity); GO:0071076 (GO:0071076)
KEGG	-
Pfam	PF03828 (PAP_assoc); PF19088 (TUTase); PF22600 (MTPAP-like_central)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792025.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057792025.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057792025.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057792025.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71396417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:71396472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:71396880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:71396900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B12,B52,C12,C4
`Chr2:71399521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr2:71399554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr2:71399579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:71399588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr2:71399615`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr2:71399615`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B97
`Chr2:71399650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:71399993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B12,B52,C12,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792025.1

707 aa

354

707

TUTase

MTPAP-like_central

PAP_assoc

PF19088 TUTase 382-499 aa PF22600 MTPAP-like_central 388-517 aa PF03828 PAP_assoc 606-665 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792025.1`	Pfam	`PF19088`	TUTase	Domain	382	499	3.1e-11	43.9	TUTase nucleotidyltransferase domain
`XP_057792025.1`	Pfam	`PF22600`	MTPAP-like_central	Domain	388	517	3e-32	112.3	Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial-like, central palm domain
`XP_057792025.1`	Pfam	`PF03828`	PAP_assoc	Family	606	665	2.2e-19	70.2	Cid1 family poly A polymerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936042.1
AGGAATCAAAAGGCTAATTACAATCCTTGGAGGAAAAGAAGTTACTTTATTACACTTATTTGATCACACTCCTATAAATCTAAAGGATTAAGTGAAAAAAGAGCCAGTTTTATGTGTGTCGGCGTCCAACAACTTCCACCATGAGCGGTCGAGGAGGCGACGCGCCGCTGCCGAATGGCGGGGAGTTCCTCCTCCAACTACTACGTAAGCAATCCAATTCAGGCCATCCTATTTTTCCGCCGCAGCCTCAGCAGCAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008922
ATGAGCGGTCGAGGAGGCGACGCGCCGCTGCCGAATGGCGGGGAGTTCCTCCTCCAACTACTACGTAAGCAATCCAATTCAGGCCATCCTATTTTTCCGCCGCAGCCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAACTTTCTCACAGGACCCGGCCGTCGCGGCGGTCGGCCCCACCATCCCCACCTTTCCGCACCCGCACGCGGCGTTCCCTCCGTCCAACGGCGGCGATTTCGCCTTCCCGCCGTGGGGTCTCCTCCCTCCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792025.1
MSGRGGDAPLPNGGEFLLQLLRKQSNSGHPIFPPQPQQQQQQQTFSQDPAVAAVGPTIPTFPHPHAAFPPSNGGDFAFPPWGLLPPPPFAQQNYFQQNPNPNPNFSSPSRGYAHSPPQFDLQSRRISPGDDARNLGFYGDNSKPSAANQPGQNLIFGSLNRDVLQNGAVNALDPSLFRRPENRFPPNSIEANENSRGNHTVLRAQKLERSSNSNDNVQQGDSGRVAVPPPGFLSDLKNVRQIEHGYGRRAPDLNGDKGKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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