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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005038`

染色体: Chr02 坐标: 72077541-72081512 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005038`
名称	SmilChr02G005038
描述	uncharacterized SmilChr02G005038
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72077541 - 72081512 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008939`
GeneID	`131008939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008939`
原始查询	`LOC131008939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ppx-GppA phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241311]; symbol=AT1G09195; hit=AT1G09195; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ppx-GppA phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241311]; symbol=AT1G09195; hit=AT1G09195; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G09195` (AT1G09195) Ppx-GppA phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241311] identity=47.4; qcov=0.986; evalue=1.16e-163; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0016462 (pyrophosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02541 (Ppx-GppA); PF21447 (Ppx-GppA_III)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792044.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792044.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057792044.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792044.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72077976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr2:72077976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr2:72077981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:72078100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:72078233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:72078471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:72078566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:72078639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:72078693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B44
`Chr2:72080969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:72081015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C6,C8
`Chr2:72081045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B24,B28,B46,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792044.1

575 aa

288

575

Ppx-GppA

Ppx-GppA_III

PF02541 Ppx-GppA 66-335 aa PF21447 Ppx-GppA_III 349-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792044.1`	Pfam	`PF02541`	Ppx-GppA	Family	66	335	6.2e-46	157.8	Ppx/GppA phosphatase family
`XP_057792044.1`	Pfam	`PF21447`	Ppx-GppA_III	Domain	349	508	3.4e-16	60.3	Ppx/GppA phosphatase, domain III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936061.1
ATATTTGATCATTAACCTTTGTACTTATTTTTTCATTGTTACGAATTTAGGCGACTTAGATTTTTACTTGCTTCTTCGAAAAAGAAAAAAAGAAAAAGATTTCTACTTGATTCAACAAAATAACATAACAGAATTAGTTAAGTTAATGTTGATTTACACATCAATGAGCAGCAGCTATCTACCTCCGGTGACCACCACGGCGACGGCCGACAAAAACTTATTCGCCGCCGTGGATATGGGCACTAACTCATTCAAACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008939
ATGTTGATTTACACATCAATGAGCAGCAGCTATCTACCTCCGGTGACCACCACGGCGACGGCCGACAAAAACTTATTCGCCGCCGTGGATATGGGCACTAACTCATTCAAACTTTCACTCGTCCACGTCGATCCATCTTCCGGCCGATTCCTCAACCTCAACCGCCTAAAAGAGCCAGTCGTACTCGGCCTCGACACCACCGCCGGCGCCATCTCCGCCGACTCCCTCGACCGCGCAATCTGCGCCCTCCGCGGTTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792044.1
MLIYTSMSSSYLPPVTTTATADKNLFAAVDMGTNSFKLSLVHVDPSSGRFLNLNRLKEPVVLGLDTTAGAISADSLDRAICALRGFQQYLHPHRLPPPRLRLVATSAVREASNKSEFIKTIHETLGLDVEIISGAEEARLIYLGVLQFFPVYNSTVLTIDIGGGSTEFTVGLRGKVLFSKSLRLGHVTLTQQYPDVGQMREHIRNELESSGLIEKISEFKLDYVIGSSGTVRAIEKAVCKGYAVKVEEAVGVPEEFAKKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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