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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005064`

染色体: Chr02 坐标: 72321375-72327195 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005064`
名称	SmilChr02G005064
描述	uncharacterized SmilChr02G005064
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72321375 - 72327195 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008958`
GeneID	`131008958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008958`
原始查询	`LOC131008958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cell cycle checkpoint control protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819713]; symbol=RAD9; hit=AT3G05480; species=arabidopsis; confidence=high
产物	cell cycle checkpoint control protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819713]; symbol=RAD9; hit=AT3G05480; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G05480` (RAD9) cell cycle checkpoint control protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819713] identity=60.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0345100` (Arf75) - identity=52.7; qcov=1.05; evalue=2.79e-144; confidence=high
GO	GO:0000076 (DNA replication checkpoint signaling); GO:0006281 (DNA repair); GO:0030896 (checkpoint clamp complex); GO:0031573 (mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling); GO:0071479 (cellular response to ionizing radiation)
KEGG	-
Pfam	PF04139 (Rad9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792089.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057792089.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057792089.1`
4	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057792089.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057792089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72321512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:72322203`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr2:72322203`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr2:72322428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B9,C35,C86,D4
`Chr2:72324710`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr2:72324710`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr2:72325008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:72325070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D1
`Chr2:72325695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792089.1

429 aa

214

429

Rad9

PF04139 Rad9 13-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792089.1`	Pfam	`PF04139`	Rad9	Family	13	282	3.1e-77	260.2	Rad9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936106.1
TTCTAAACTACTTGGAAACTGACGCGGCTATACCTCCAAAACCGCAGATGTTACAAATCATCTTCCCGCCATAAAACTTACCTCGGCTTGAGCTAGACAAGGAACTATCCAAACCAGCAATGGAGTTCAGTGTGAGCGGTACTGCGCTTAAAACCTTCGCTCGCTCCATCACTTGCCTCGCCCGTATCGGCAACGAGCTCGTTTTCCAGTCCTCTGCTTCTCAGCTATGTCTCCATACTCTCAACTCATCAAGGTCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008958
ATGGAGTTCAGTGTGAGCGGTACTGCGCTTAAAACCTTCGCTCGCTCCATCACTTGCCTCGCCCGTATCGGCAACGAGCTCGTTTTCCAGTCCTCTGCTTCTCAGCTATGTCTCCATACTCTCAACTCATCAAGGTCGGCTTATCAATCCATAACATTCAAACCAGATTTCTTTGATGTATTCTCAGTATCTGGGGCCCAAGTACAATGCAGTGTCCTTCTGAAGGCCATTTGCTCAGTTCTAAGAACACCAGTGGCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792089.1
MEFSVSGTALKTFARSITCLARIGNELVFQSSASQLCLHTLNSSRSAYQSITFKPDFFDVFSVSGAQVQCSVLLKAICSVLRTPVASIDHLTVQLADSDASKVQWALDCSNGMKKTYWITCNFEPDIQHLSLDRRKLPSSFVVRPRDLNRLLANFQSTLQEITIISTQQSTLPLDAADQIGGKAVEFRSYIDPTKENDSSLHTQLWIDPAEEFVQYTHTRDPVDVTFGVKELKAFLSFCEGCEVDIHLYFDKAGEPILMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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